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拟南芥中环形RNA的生物信息学分析
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拟南芥中环形RNA的生物信息学分析
论文目录
摘要
第1-8页
ABSTRACT
第8-14页
缩略词表
第14-15页
1 前言
第15-37页
1.1 拟南芥生物学研究基础
第15-17页
1.2 环形RNA简介
第17-24页
1.2.1 环形RNA的形成机制
第18-21页
1.2.2 环形RNA的主要特征
第21页
1.2.3 环形RNA的基因调控功能
第21-24页
1.3 环形RNA的测序及建库方式
第24-25页
1.4 环形RNA已有数据库
第25-29页
1.5 环形RNA的预测方法
第29-33页
1.6 miRNA结合方式
第33-34页
1.7 RNA-seq技术特点
第34-35页
1.8 研究目的及意义
第35-37页
2 材料与方法
第37-51页
2.1 数据来源和生物信息学工具
第37-39页
2.1.1 RNA-seq数据来源
第37-38页
2.1.2 microRNA数据来源
第38页
2.1.3 拟南芥参考基因组以及基因组注释信息来源
第38页
2.1.4 生物信息学工具
第38-39页
2.2 数据分析方法
第39-51页
2.2.1 数据预处理
第40-43页
2.2.2 环形RNA的预测
第43-44页
2.2.3 表达量统计
第44-48页
2.2.4 GO富集分析
第48-51页
3 结果与分析
第51-61页
3.1 拟南芥环形RNA的预测结果
第51-53页
3.2 表达量统计分析结果
第53-55页
3.3 GO富集分析结果
第55-61页
4 结论
第61-63页
5 讨论与展望
第63-65页
5.1 讨论
第63-64页
5.2 展望
第64-65页
致谢
第65-67页
参考文献
第67-73页
附录Ⅰ 拟南芥2310个候选环形RNA列表
第73-115页
附录Ⅱ 差异表达分析结果
第115-129页
附录Ⅲ 攻读硕士学位期间发表论文情况
第129页
本篇论文共
129
页,
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