基于AFP的序列无关蛋白质结构比对算法研究

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基于AFP的序列无关蛋白质结构比对算法研究

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基于AFP的序列无关蛋白质结构比对算法研究

论文目录
中文摘要	第1-4页
Abstract	第4-8页
第一章绪论	第8-16页
1.1 研究背景	第8-12页
1.2 蛋白质结构	第12-14页
1.3 蛋白质结构比对意义	第14页
1.4 蛋白质结构比对现存的问题	第14-15页
1.5 本课题工作	第15-16页
第二章蛋白质结构比对	第16-23页
2.1 蛋白质结构表示	第17页
2.2 蛋白质结构观察视角	第17-18页
2.3 如何构建蛋白质结构对齐	第18-23页
2.3.1 相似性打分函数	第19-20页
2.3.2 搜索算法	第20-23页
第三章序列无关蛋白质结构比对算法	第23-29页
3.1 序列无关蛋白质结构比对	第23页
3.2 目前主流的序列无关蛋白质结构比对算法	第23-29页
3.2.1 MASS	第23-24页
3.2.2 GANGSTA+	第24-25页
3.2.3 SCALI	第25页
3.2.4 SNAP	第25-26页
3.2.5 SAMO	第26页
3.2.6 DEDAL	第26-27页
3.2.7 MICAN	第27-29页
第四章一种新的基于AFP的序列无关蛋白质结构比对算法	第29-45页
4.1 引言	第29-30页
4.2 算法的实现	第30-38页
4.2.1 变长AFP	第30-33页
4.2.2 通过最大团得到蛋白质结构初始对齐	第33-36页
4.2.3 蛋白质结构对齐迭代优化过程	第36-38页
4.3 实验结果及性能评估	第38-45页
4.3.1 数据集	第39页
4.3.2 评价标准	第39-40页
4.3.3 参数选择	第40-42页
4.3.4 实验结果评价	第42-45页
第五章总结与展望	第45-47页
5.1 总结	第45-46页
5.2 展望	第46-47页
参考文献	第47-52页
在学期间的研究成果	第52-53页
致谢	第53页

本篇论文共53页，点击这进入下载页面。

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