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非辅因子依赖型高效木糖代谢途径适配菌株的功能基因组学分析

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非辅因子依赖型高效木糖代谢途径适配菌株的功能基因组学分析
论文目录
 
摘要第1-9页
ABSTRACT第9-12页
缩略词表第12-13页
第一章 前言第13-21页
  1.1 木质纤维素燃料乙醇第13页
  1.2 乙醇生产首选菌株——酿酒酵母第13页
  1.3 木糖还原酶-木糖醇脱氢酶途径第13-14页
  1.4 木糖异构酶途径第14页
  1.5 下游途径改造第14-15页
  1.6 其他相关基因对木糖代谢的影响第15页
  1.7 木糖代谢重组菌株的驯化及系统生物学分析第15-18页
    1.7.1 木糖代谢重组菌株的驯化第15-17页
    1.7.2 系统生物学研究第17-18页
  1.8 酿酒酵母Ask10p蛋白参与胁迫应答第18-20页
  1.9 实验室前期工作第20页
  1.10 本论文研究内容第20-21页
第二章 材料与方法第21-36页
  2.1 实验仪器和耗材第21页
  2.2 菌株和质粒第21-24页
  2.3 引物第24-26页
  2.4 实验方法第26-36页
    2.4.1 DNA扩增、纯化和测序第26页
    2.4.2 一步恒温连接(Gibson Assembly)第26页
    2.4.3 大肠杆菌质粒提取第26-27页
    2.4.4 大肠杆菌转化第27页
    2.4.5 酵母转化第27-28页
    2.4.6 酵母质粒提取第28页
    2.4.7 酵母染色体提取第28页
    2.4.8 基因敲除和基因原位突变第28-30页
    2.4.10 Ru-Ⅺ酶活测定第30页
    2.4.11 acZ酶活测定第30-31页
    2.4.12 XR-XDH酶活测定第31页
    2.4.13 ELISA蛋白含量测定第31-32页
    2.4.14 点滴平板实验第32页
    2.4.15 基因组测序第32-33页
    2.4.16 酵母总RNA提取第33-34页
    2.4.17 RNA反转录和荧光定量PCR第34页
    2.4.18 转录组分析第34-36页
第三章 结果与分析第36-55页
  3.1 驯化后菌株木糖异构酶各个水平测定第36-40页
  3.2 基因组分析第40-43页
    3.2.1 测序结果总结第40-42页
    3.2.2 突变基因功能富集分析第42-43页
  3.3 突变基因功能鉴定第43-46页
    3.3.1 背景菌株选择第43页
    3.3.2 候选基因菌株构建第43-44页
    3.3.3 木糖平板生长实验第44-46页
  3.4 ASK10功能分析第46-51页
    3.4.1 点突变M475R对ASK10功能完整性的影响第46-47页
    3.4.2 ASK10原位突变和敲除/超表达菌木糖生长实验第47-49页
    3.4.3 ASK10对木糖代谢的影响第49-51页
  3.5 转录组分析第51-55页
    3.5.1 测序质量评估第51-52页
    3.5.2 差异基因筛选和分析第52-55页
全文总结第55-57页
附录第57-60页
参考文献第60-65页
致谢第65-66页
附件第66页

本篇论文共66页,点击这进入下载页面
 
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