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非辅因子依赖型高效木糖代谢途径适配菌株的功能基因组学分析
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非辅因子依赖型高效木糖代谢途径适配菌株的功能基因组学分析
论文目录
摘要
第1-9页
ABSTRACT
第9-12页
缩略词表
第12-13页
第一章 前言
第13-21页
1.1 木质纤维素燃料乙醇
第13页
1.2 乙醇生产首选菌株——酿酒酵母
第13页
1.3 木糖还原酶-木糖醇脱氢酶途径
第13-14页
1.4 木糖异构酶途径
第14页
1.5 下游途径改造
第14-15页
1.6 其他相关基因对木糖代谢的影响
第15页
1.7 木糖代谢重组菌株的驯化及系统生物学分析
第15-18页
1.7.1 木糖代谢重组菌株的驯化
第15-17页
1.7.2 系统生物学研究
第17-18页
1.8 酿酒酵母Ask10p蛋白参与胁迫应答
第18-20页
1.9 实验室前期工作
第20页
1.10 本论文研究内容
第20-21页
第二章 材料与方法
第21-36页
2.1 实验仪器和耗材
第21页
2.2 菌株和质粒
第21-24页
2.3 引物
第24-26页
2.4 实验方法
第26-36页
2.4.1 DNA扩增、纯化和测序
第26页
2.4.2 一步恒温连接(Gibson Assembly)
第26页
2.4.3 大肠杆菌质粒提取
第26-27页
2.4.4 大肠杆菌转化
第27页
2.4.5 酵母转化
第27-28页
2.4.6 酵母质粒提取
第28页
2.4.7 酵母染色体提取
第28页
2.4.8 基因敲除和基因原位突变
第28-30页
2.4.10 Ru-Ⅺ酶活测定
第30页
2.4.11 acZ酶活测定
第30-31页
2.4.12 XR-XDH酶活测定
第31页
2.4.13 ELISA蛋白含量测定
第31-32页
2.4.14 点滴平板实验
第32页
2.4.15 基因组测序
第32-33页
2.4.16 酵母总RNA提取
第33-34页
2.4.17 RNA反转录和荧光定量PCR
第34页
2.4.18 转录组分析
第34-36页
第三章 结果与分析
第36-55页
3.1 驯化后菌株木糖异构酶各个水平测定
第36-40页
3.2 基因组分析
第40-43页
3.2.1 测序结果总结
第40-42页
3.2.2 突变基因功能富集分析
第42-43页
3.3 突变基因功能鉴定
第43-46页
3.3.1 背景菌株选择
第43页
3.3.2 候选基因菌株构建
第43-44页
3.3.3 木糖平板生长实验
第44-46页
3.4 ASK10功能分析
第46-51页
3.4.1 点突变M475R对ASK10功能完整性的影响
第46-47页
3.4.2 ASK10原位突变和敲除/超表达菌木糖生长实验
第47-49页
3.4.3 ASK10对木糖代谢的影响
第49-51页
3.5 转录组分析
第51-55页
3.5.1 测序质量评估
第51-52页
3.5.2 差异基因筛选和分析
第52-55页
全文总结
第55-57页
附录
第57-60页
参考文献
第60-65页
致谢
第65-66页
附件
第66页
本篇论文共
66
页,
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。
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