群体微囊藻XW01无菌化培养及全基因组测序

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群体微囊藻XW01无菌化培养及全基因组测序

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群体微囊藻XW01无菌化培养及全基因组测序

论文目录
摘要	第1-4页
Abstract	第4-9页
第1章前言	第9-19页
1 蓝藻的概述	第9-10页
1.1 蓝藻的危害	第9页
1.2 蓝藻与环境微生物共生的方式	第9-10页
2 微囊藻主要无菌化方法及无菌化研究进展	第10-13页
2.1 物理方法	第10-11页
2.2 化学方法	第11-12页
2.3 抗生素的使用	第12-13页
3 基因组和蓝藻基因组学研究进展	第13-17页
3.1 蓝藻基因组学研究进展	第13-15页
3.2 蓝藻基因组学研究	第15-17页
3.2.1 蓝藻结构基因组学的研究	第16-17页
3.2.2 蓝藻功能基因组学的研究	第17页
4 本论文研究的目的及意义	第17-18页
5 技术路线	第18-19页
第2章不同方法纯化群体铜绿微囊藻XW01的比较研究	第19-44页
第1节常规物理方法分离纯化铜绿微囊藻XW01效果比较	第19-24页
1 实验材料	第19页
1.1 实验藻种	第19页
1.2 藻种培养	第19页
2 实验方法	第19-20页
2.1 藻液中藻细胞与细菌数量的测定	第20页
2.2 常规物理方法常规物理方法分离纯化铜绿微囊藻XW01	第20页
2.2.1 离心洗涤法	第20页
2.2.2 稀释划线法	第20页
2.2.3 超声波震荡洗涤法	第20页
2.3 数据计算及统计分析	第20页
3 结果与分析	第20-24页
3.1 微囊藻培养过程中细菌含量的变化	第20-21页
3.2 常规物理方法常规物理方法分离纯化铜绿微囊藻XW01	第21-23页
3.2.1 离心洗涤除菌效果分析	第21-22页
3.2.2 稀释平板法除菌效果分析	第22-23页
3.2.3 超声波震荡洗涤法除菌效果分析	第23页
3.3 常规物理纯化方法除菌效果的比较与分析	第23-24页
4 讨论	第24页
第2节抗生素处理法纯化微囊藻XW01	第24-39页
1 实验化学试剂	第25-26页
2 实验方法	第26-28页
2.1 抗生素对XW01生长的影响	第26页
2.2 XW01藻液中细菌的分离鉴定	第26-27页
2.2.1 菌种的培养	第26页
2.2.2 细菌基因组DNA的提取	第26页
2.2.3 16S rDNA序列扩增	第26-27页
2.2.4 16S rDNA序列测定	第27页
2.3 分离细菌对抗生素的敏感性检测	第27页
2.4 抗生素除菌时间的选择	第27-28页
2.5 抗生素作用后藻的处理	第28页
3 结果与分析	第28-38页
3.1 五种抗生素对XW01生长的影响	第28-31页
3.2 XW01藻液中细菌的分离鉴定结果	第31-35页
3.2.1 附生细菌的分离培养结果	第31-32页
3.2.2 菌株PCR检测结果	第32-33页
3.2.3 序列分析结果	第33-35页
3.3 分离细菌对抗生素的敏感性检测结果	第35-36页
3.4 抗生素除菌时间的选择结果	第36-37页
3.5 抗生素作用后藻的处理结果	第37-38页
4 讨论	第38-39页
第3节紫外(UV)照射处理法纯化微囊藻	第39-44页
1 实验方法	第39-40页
1.1 实验室培养藻紫外(UV)照射除菌	第39-40页
1.2 阳光(UV)诱导处理	第40页
1.3 抗生素结合UV照射的除菌效果	第40页
2 实验结果	第40-43页
2.1 实验室培养藻紫外(UV)照射除菌结果分析	第40-41页
2.2 阳光(UV)诱导处理结果分析	第41页
2.3 抗生素结合UV照射的除菌效果分析	第41-43页
3 讨论	第43-44页
第3章群体微囊藻XW01全基因组测序	第44-56页
1 实验材料	第44页
1.1 实验试剂	第44页
1.2 实验仪器	第44页
2 实验方法	第44-48页
2.1 提取XW01基因组DNA	第44-45页
2.2 Illumina Hiseq2000测序流程	第45-46页
2.3 序列组装及生物信息学分析	第46-48页
2.3.1 组装	第46-47页
2.3.2 基因组组分分析	第47-48页
2.3.4 比较基因组分析	第48页
3 实验结果	第48-55页
3.1 电泳图谱	第48页
3.2 基因组概述	第48-49页
3.2.1 测序的基本数据	第48-49页
3.2.2 测序数据的处理和结果	第49页
3.3 基因组组分分析	第49-51页
3.3.1 基因成分分析	第49-50页
3.3.2 重复序列分析	第50-51页
3.3.3 非编码RNA	第51页
3.4 基因功能分析-通用功能注释	第51-53页
3.5 比较基因组分析结果	第53-55页
4 讨论	第55-56页
本文小结	第56-57页
参考文献	第57-64页
附录	第64-65页
在读期间发表的学术论文及研究成果	第65-66页
致谢	第66页

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