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基于新一代测序数据的启动子类型识别研究

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基于新一代测序数据的启动子类型识别研究
论文目录
 
摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
第1章 绪论第8-19页
  1.1 课题背景及研究的目的和意义第8-15页
    1.1.1 课题背景第8-12页
    1.1.2 研究目的和意义第12-15页
  1.2 国内外研究现状分析第15-17页
    1.2.1 国内外研究现状第15-16页
    1.2.2 启动子相关识别软件第16-17页
  1.3 本文的主要研究内容第17-19页
第2章 多细胞系基因表达研究第19-30页
  2.1 前言第19页
  2.2 数据获取及处理第19-24页
  2.3 多细胞系基因表达情况分析第24-27页
  2.4 基因表达水平与转录起始位点之间距离的关系第27-29页
  2.5 本章小结第29-30页
第3章 基于新一代测序数据启动子类型识别第30-39页
  3.1 前言第30页
  3.2 数据获取及处理第30-33页
  3.3 多细胞系启动子类型识别第33-38页
    3.3.1 基于RNA聚合酶II测序数据的启动子类型识别第33-34页
    3.3.2 基于隐式马尔科夫模型的启动子类型识别第34-38页
  3.4 本章小结第38-39页
第4章 机器学习方法在启动子识别研究中的应用第39-49页
  4.1 前言第39-40页
  4.2 数据获取及处理第40-41页
  4.3 组蛋白修饰特征第41-43页
  4.4 基于机器学习算法的启动子类型识别预测第43-48页
    4.4.1 支持向量机简述第44页
    4.4.2 随机森林简述第44页
    4.4.3 基于组蛋白修饰特征的启动子类型识别预测第44-48页
  4.5 本章小结第48-49页
结论第49-51页
参考文献第51-57页
攻读硕士学位期间发表的论文第57-59页
致谢第59页

本篇论文共59页,点击这进入下载页面
 
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