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溶菌酶蛋白质内部空间远程相关性研究
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溶菌酶蛋白质内部空间远程相关性研究
论文目录
中文摘要
第1-6页
ABSTRACT
第6-10页
第1章 绪论
第10-23页
1.1 前言
第10-11页
1.2 蛋白质结构与别构效应
第11-14页
1.3 分子动力学模拟
第14-17页
1.3.1 发展历史
第15-16页
1.3.2 应用领域和局限性
第16-17页
1.3.3 生物体系的分子动力学模拟
第17页
1.4 相关性分析
第17-21页
1.4.1 皮尔逊相关系数
第18页
1.4.2 循环相关系数
第18-19页
1.4.3 互信息
第19-20页
1.4.4 交互信息
第20-21页
1.5 HEWL简介
第21页
1.6 本论文的研究内容
第21-23页
第2章 实验方法
第23-28页
2.1 分子动力学模拟轨迹
第23页
2.2 主链二面角及残基编号
第23-24页
2.3 主链二面角角度分布
第24页
2.4 主链二面角之间的距离
第24-25页
2.5 基于主链二面角的相关性分析
第25-27页
2.5.1 循环相关系数的计算
第25页
2.5.2 互信息的计算
第25-26页
2.5.3 交互信息的计算
第26页
2.5.4 子数据集互信息差异矩阵
第26-27页
2.6 基于残基的互信息计算
第27页
2.7 三维结构展示
第27-28页
第3章 结果与讨论
第28-46页
3.1 HEWL结构
第28-29页
3.2 主链二面角角度分布
第29-30页
3.3 主链二面角之间的距离
第30-31页
3.4 基于主链二面角的相关性分析
第31-36页
3.4.1 CCC计算结果
第31页
3.4.2 MI计算结果
第31-32页
3.4.3 MI与CCC
第32-33页
3.4.4 MI与距离
第33-34页
3.4.5 MI与二级结构
第34-36页
3.5 主链二面角子数据集的相关性分析
第36-38页
3.5.1 MI差异
第36页
3.5.2 MI差异在距离上的分布
第36-38页
3.6 主链二面角的II
第38-41页
3.6.1 Ⅱ与子数据集MI差异
第38-39页
3.6.2 Ⅱ与空间结构位置
第39-41页
3.7 残基间互信息
第41-43页
3.7.1 MI计算结果
第41-42页
3.7.2 MI与空间结构位置
第42-43页
3.8 调节位点预测
第43-46页
第4章 总结与展望
第46-48页
4.1 结论
第46页
4.2 创新点
第46页
4.3 后续研究展望
第46-48页
参考文献
第48-53页
作者简介
第53-54页
后记和致谢
第54页
本篇论文共
54
页,
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。
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