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整合组学数据构建条件特异性代谢网络模型

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整合组学数据构建条件特异性代谢网络模型
论文目录
 
摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
第一章 绪论第9-26页
  1.1 系统生物学发展及代谢网络研究现状第9-13页
  1.2 整合组学数据构建条件特异性代谢网络第13-16页
  1.3 整合组学数据方法探究植物生理机制第16-25页
    1.3.1 C3和C4类型植物的生理差异第17-19页
    1.3.2 整合转录组数据探究拟南芥应对不同CO_2的机制第19-21页
    1.3.3 整合蛋白质组数据的特异性代谢网络揭示玉米叶片发育机制第21-25页
  1.4 目的及意义第25-26页
第二章 整合组学数据构建特异代谢网络方法及其比较第26-38页
  2.1 流平衡分析方法第26-29页
  2.2 基于阈值设定约束反应活性的整合方法第29-30页
  2.3 最大契合表达水平和代谢水平的整合方法第30-32页
  2.4 检验表达状态确定反应开关的整合方法第32-34页
  2.5 基于函数关系连续约束流值的整合方法第34-36页
  2.6 基于活性反应频率确定活性网络模型的整合方法第36-38页
第三章 整合转录组数据探究拟南芥对不同CO_2浓度的响应第38-51页
  3.1 不同CO_2浓度特异代谢网络模型的构建第38-42页
    3.1.1 数据的收集第38-41页
    3.1.2 整合组学数据方法的选择第41页
    3.1.3 整合组学数据构建特异代谢网络模型第41-42页
  3.2 特异代谢网络模型的分析第42-45页
    3.2.1 不同CO_2浓度下特异代谢网络模型第42-43页
    3.2.2 不同CO_2浓度下特异代谢网络模型的流分布分析第43-45页
  3.3 基因表达到代谢流层面探究拟南芥对不同CO_2浓度的响应第45-48页
    3.3.1 特定CO_2浓度下差异基因的富集分析第45-46页
    3.3.2 从基因到代谢流在特定CO_2浓度下的KEGG富集分析第46-48页
  3.4 潜在的转录后调控基因的预测和验证第48-50页
  3.5 本章小结第50-51页
第四章 构建特异区段网络模型揭示玉米光合途径建成机制第51-58页
  4.1 整合蛋白质组学数据构建特异代谢模型第51-53页
    4.1.1 蛋白质组学数据的搜集和整理第51-52页
    4.1.2 整合组学数据方法的选择第52-53页
    4.1.3 整合蛋白质组学数据构建特异代谢模型第53页
  4.2 玉米叶片不同发育阶段特异代谢网络模型差异第53-57页
    4.2.1 玉米叶片不同发育区段光合效率的差异第54-55页
    4.2.2 玉米叶片不同发育阶段主要光合途径反应代谢差异第55-56页
    4.2.3 不同叶片发育阶段光合途径的建成第56-57页
  4.3 本章小结第57-58页
第五章 总结与展望第58-61页
  5.1 主要工作和创新点第58-59页
  5.2 后续工作展望第59-61页
    5.2.1 全基因组的代谢网络模型和高通量数据第59-60页
    5.2.2 整合组学数据方法第60页
    5.2.3 整合调控网络第60-61页
参考文献第61-65页
致谢第65-66页
攻读硕士期间学术成果第66-68页

本篇论文共68页,点击这进入下载页面
 
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