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抗生素zwittermicin A标品制备与定量方法的建立及zwittermicin A生物合成基因簇中关键基因的功能研究

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分类:教育论文网→生物科学论文→分子生物学论文基因工程(遗传工程)论文
抗生素zwittermicin A标品制备与定量方法的建立及zwittermicin A生物合成基因簇中关键基因的功能研究
论文目录
 
摘要第1-12页
Abstract第12-15页
缩略语表第15-16页
第一章 Zwittermicin A标准品的纯化制备及发酵样品中zwittermicin A含量的绝对定量第16-37页
1 前言第16-23页
  1.1 次级代谢产物的分离纯化第16-18页
    1.1.1 样品预处理第16页
    1.1.2 样品初分离第16-17页
    1.1.3 样品精制第17-18页
  1.2 Zwittermicin A的分离纯化第18-22页
    1.2.1 Zwittermicin A的结构及性质第18-19页
    1.2.2 Zwittermicin A的纯化方法及效果第19-22页
  1.3 本研究的目的及新意第22-23页
2 材料与方法第23-26页
  2.1 实验材料第23页
    2.1.1 试剂第23页
    2.1.2 柱填料及仪器第23页
  2.2 实验方法第23-26页
    2.2.1 Zwittermicin A纯品制备方法第23-25页
      2.2.1.1 发酵液预处理第23页
      2.2.1.2 阳离子交换第23-24页
      2.2.1.3 薄层层析第24页
      2.2.1.4 硅胶柱层析第24页
      2.2.1.5 高效液相色谱纯品制备及分析第24-25页
    2.2.2 发酵样品中zwittermicin A的快速定量第25-26页
      2.2.2.1 发酵液预处理第25页
      2.2.2.2 阳离子交换第25页
      2.2.2.3 液相色谱定量第25页
      2.2.2.4 一级质谱定量第25-26页
3 结果与分析第26-36页
  3.1 Zwittermicin A纯品的分离制备第26-33页
    3.1.1 发酵液预处理对活性物质的抑菌能力影响第26页
    3.1.2 洗脱收集液pH突变前后的抑菌能力分析第26-27页
    3.1.3 硅胶柱层析对zwittermicin A的分离效果分析第27-29页
      3.1.3.1 硅胶柱层析步骤的必要性第27页
      3.1.3.2 薄层层析展层条件的摸索第27-29页
      3.1.3.3 硅胶柱层析分离zwittermicin A过程第29页
    3.1.4 Zwittermicin A纯品制备及定量分析的液相条件摸索第29-31页
    3.1.5 Zwittermicin A纯品制备结果第31-33页
  3.2 发酵样品中zwittermicin A含量的绝对定量第33-36页
    3.2.1 发酵样品初提纯的必要性第33页
    3.2.2 发酵样品初提纯的方法探索第33页
    3.2.3 发酵样品初提样中zwittermicin A含量的定量结果第33-36页
      3.2.3.1 Zwittermicin A标准曲线的制作第34-35页
      3.2.3.2 定量结果第35-36页
  3.3 小结第36页
4 讨论第36-37页
第二章 抗生素zwittermicin A生物合成基因簇中关键基因的功能研究第37-95页
1、前言第37-59页
  1.1 抗生素的定义及分类第37-42页
    1.1.1 核糖体肽类第37-38页
    1.1.2 非核糖体肽类第38-39页
    1.1.3 聚酮类第39-41页
      1.1.3.1 一型聚酮第39-40页
      1.1.3.2 二型聚酮第40页
      1.1.3.3 三型聚酮第40-41页
      1.1.3.4 其它第41页
    1.1.4 非核糖体肽-聚酮杂合类第41-42页
    1.1.5 其它第42页
  1.2 抗生素zwittermicin A生物合成研究基础第42-57页
    1.2.1 Zwittermicin A的发现第42-43页
    1.2.2 Zwittermicin A的性质第43-44页
      1.2.2.1 Zwittermicin A的抑菌性质第43页
      1.2.2.2 Zwittermicin A的增效性质第43-44页
    1.2.3 Zwittermicin A的作用机制第44页
    1.2.4 Zwittermicin A的生物合成基因簇研究第44-46页
    1.2.5 Zwittermicin A的生物合成途径研究第46-48页
    1.2.6 Zwittermicin A生物合成相关基因功能的研究第48-57页
      1.2.6.1 zmaR基因功能的研究第48-49页
      1.2.6.2 zmaS基因功能的初步研究第49-52页
      1.2.6.3 zmaM基因功能的初步研究第52-53页
      1.2.6.4 Zwittermicin A释放机制的研究第53-57页
  1.3 本研究的目的及新颖性第57-59页
2 材料与方法第59-68页
  2.1 实验材料第59-64页
    2.1.1 菌株、质粒和引物第59页
    2.1.2 培养基第59页
    2.1.3 试剂第59-64页
      2.1.3.1 抽质粒用试剂第59页
      2.1.3.2 抽芽胞杆菌总DNA用试剂第59页
      2.1.3.3 大肠杆菌感受态制备试剂第59页
      2.1.3.4 芽胞杆菌感受态制备试剂第59-60页
      2.1.3.5 蛋白操作用试剂第60-64页
      2.1.3.6 其它第64页
    2.1.4 仪器第64页
  2.2 实验方法第64-68页
    2.2.1 DNA操作方法第64-66页
      2.2.1.1 大肠杆菌质粒的抽提第64页
      2.2.1.2 蜡状芽胞杆菌质粒的抽提第64-65页
      2.2.1.3 大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第65页
      2.2.1.4 蜡状芽胞杆菌感受态细胞的制备及转化第65页
      2.2.1.5 蜡状芽胞杆菌总DNA的抽提第65-66页
      2.2.1.6 体外重组实验第66页
    2.2.2 蛋白质操作方法第66-67页
      2.2.2.1 蛋白质的诱导表达第66页
      2.2.2.2 蛋白质的纯化第66页
      2.2.2.3 蛋白质的脱盐第66页
      2.2.2.4 蛋白质的纯度检测及定量第66-67页
      2.2.2.5 蛋白质体外催化实验第67页
      2.2.2.6 MALDI-TOF-TOF检测蛋白催化结果第67页
    2.2.3 Zwittermicin A的检测方法第67页
      2.2.3.1 Zwittermicin A的活性检测第67页
      2.2.3.2 Zwittermicin A的质谱检测第67页
    2.2.4 序列分析方法第67-68页
      2.2.4.1 核酸序列分析第67页
      2.2.4.2 蛋白质序列分析第67-68页
3 结果与分析第68-90页
  3.1 PPTase编码基因zmaS的功能研究第68-78页
    3.1.1 前期基础及本研究技术路线第68页
    3.1.2 zmaS对zwittermicin A和kanosamine的调控能力分析第68-70页
      3.1.2.1 UW85及UW86 72h发酵上清抑菌能力分析第68页
      3.1.2.2 UW85及UW86 72h发酵上清纯化后抑菌能力分析第68-69页
      3.1.2.3 UW85及UW86中zwittermicin A及kanosamine产量分析第69-70页
    3.1.3 zmaS对kanosamine的调控水平分析第70-73页
      3.1.3.1 pBMB1962及pBMB1963的构建与验证第70-71页
      3.1.3.2 pBMB1962及pBMB1963转化宿主菌UW85与验证第71-72页
      3.1.3.3 BMB1969、BMB1970和BMB1971的抑菌能力分析第72页
      3.1.3.4 BMB1969、BMB1970和BMB1971中zwittermicin A及kanosamine产量分析第72-73页
    3.1.4 zmaS的PPTase催化功能体外验证第73-76页
      3.1.4.1 ZmaS体外催化用蛋白的分离纯化第73-75页
      3.1.4.2 ZmaS体外催化条件的摸索第75-76页
      3.1.4.3 ZmaS体外催化反应结果的质谱检测第76页
    3.1.5 小结第76-78页
  3.2 双功能域编码基因zmaM的功能研究第78-86页
    3.2.1 前期基础及本研究技术路线第78页
    3.2.2 BMB1354、BMB1355和UW85的抑菌能力比较第78-79页
    3.2.3 BMB1354、BMB1355和UW85中zwittermicin A及kanosamine的产量分析第79-80页
    3.2.4 BMB1354、BMB1355和UW85中胞内外乙酰化zwittermicin A产量分析第80-81页
    3.2.5 基于YBT-1520基因组的zmaM类似功能蛋白分析第81-82页
    3.2.6 小结第82-86页
  3.3 Zwittermicin A释放机制的研究第86-90页
    3.3.1 前期基础及本研究技术路线第86页
    3.3.2 Zwittermicin A Te释放机制突变体相关载体构建与验证第86-87页
    3.3.3 Zwittermicin A Te释放机制突变体筛选与表型检测第87页
    3.3.4 Zwittermicin A Te释放机制突变体的活性物质产生情况分析第87-89页
    3.3.5 小结第89-90页
4 讨论第90-95页
  4.1 zmaS的功能研究第90-91页
  4.2 zmaM的功能研究第91-93页
  4.3 Zwittermicin A释放机制的研究第93-95页
参考文献第95-99页
致谢第99-101页
附录第101页

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