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利用密码子偏好性对大肠杆菌异源蛋白进行可控表达

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利用密码子偏好性对大肠杆菌异源蛋白进行可控表达
论文目录
 
摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
第一章 前言第12-19页
1 大肠杆菌表达系统的组成第12-14页
  1.1 表达载体第12-13页
    1.1.1 启动子第12-13页
    1.1.2 SD序列第13页
    1.1.3 转录终止子第13页
  1.2 外源基因结构第13页
  1.3 表达宿主菌第13-14页
2 大肠杆菌表达系统存在的一些问题第14-15页
3 影响外源基因表达的因素第15-16页
  3.1 转录水平因素对外源基因表达的影响第15页
  3.2 翻译水平因素对外源基因表达的影响第15-16页
4 密码子偏好性对蛋白表达的影响第16-18页
  4.1 密码子偏好性第16-17页
  4.2 稀有密码子对蛋白表达的影响第17-18页
5 本研究的目的、意义及主要内容第18-19页
第二章 材料与方法第19-36页
1 焦磷酸酶的克隆表达及稀有密码子对其表达的影响第19-26页
  1.1 材料、仪器与试剂第19-21页
    1.1.1 实验材料第19页
    1.1.2 主要仪器第19-20页
    1.1.3 培养基和溶液第20页
    1.1.4 生化试剂第20-21页
  1.2 方法与步骤第21-26页
    1.2.1 引物设计第21页
    1.2.2 酵母基因组DNA的提取第21-22页
    1.2.3 稀有密码子系列无机焦磷酸酶基因扩增第22页
    1.2.4 DNA产物纯化试剂盒纯化PCR产物第22-23页
    1.2.5 质粒的提取第23页
    1.2.6 质粒pET-28a(+)和目的片段的双酶切第23-24页
    1.2.7 普通DNA凝胶回收试剂盒回收目的片段第24页
    1.2.8 原核表达载体pET-28a(+)与目的片段连接第24页
    1.2.9 大肠杆菌DH5α化转感受态细胞的制备第24-25页
    1.2.10 连接产物的转化第25页
    1.2.11 阳性克隆子的筛选与鉴定第25页
    1.2.12 重组质粒转化至表达宿主菌第25页
    1.2.13 表达蛋白的SDS-PAGE分析第25-26页
2 定点突变筛选不同密码子调控元件下调蛋白表达第26-30页
  2.1 材料、仪器与试剂第26-27页
    2.1.1 实验材料第26-27页
    2.1.2 主要仪器第27页
    2.1.3 培养基和溶液第27页
  2.2 方法与步骤第27-30页
    2.2.1 突变位点的确定第27-28页
    2.2.2 突变方法第28页
    2.2.3 突变引物设计第28-29页
    2.2.4 PCR扩增质粒进行点突变第29页
    2.2.5 无机焦磷酸酶相对活性分析第29-30页
3 密码子调控元件在不同位置以及不同表达系统对蛋白表达的影响第30-31页
  3.1 材料、仪器与试剂第30页
    3.1.1 实验材料第30页
    3.1.2 主要仪器第30页
    3.1.3 培养基和溶液第30页
  3.2 方法与步骤第30-31页
    3.2.1 引物设计第30-31页
    3.2.2 稀有密码子系列无机焦磷酸酶基因扩增第31页
4 密码子调控元件在不同蛋白及代谢途经改造上的应用第31-36页
  4.1 材料、仪器与试剂第31-32页
    4.1.1 实验材料第31-32页
    4.1.2 主要仪器第32页
    4.1.3 培养基和溶液第32页
  4.2 方法与步骤第32-36页
    4.2.1 引物设计第32-33页
    4.2.2 细菌基因组DNA的提取第33页
    4.2.3 β-葡萄糖苷酶的扩增第33-34页
    4.2.4 β-葡萄糖苷酶的相对活性测定第34页
    4.2.5 IspG的扩增第34-35页
    4.2.6 Neurosporene产量检测方法第35-36页
第三章 结果与分析第36-61页
1 不同数量的稀有密码子R(精氨酸)对蛋白表达的影响第36-39页
  1.1 不同数量R系列无机焦磷酸酶(PPA)基因的扩增第36页
  1.2 R密码子系列无机焦磷酸酶原核表达载体的构建第36-37页
  1.3 稀有密码子对无机焦磷酸酶蛋白表达的影响第37-38页
  1.4 R密码子系列无机焦磷酸酶在Rosetta(DE3)中进行表达第38-39页
2 利用DPN Ⅰ定点突变法获得不同的密码子调控元件第39-43页
  2.1 定点突变无机焦磷酸酶基因的扩增及测序鉴定第39页
  2.2 不同的密码子调控元件对无机焦磷酸酶蛋白表达的影响第39-41页
  2.3 不同的密码子调控元件下无机焦磷酸酶的相对活性分析第41-43页
    2.3.1 无机焦磷酸酶反应初速率时间范围的确定第41页
    2.3.2 无机焦磷酸酶的相对活性分析第41-42页
    2.3.3 不同的密码子调控元件载体在Rosetta中蛋白表达第42-43页
3 不同位置密码子对无机焦磷酸酶表达的影响第43-46页
  3.1 密码子系列无机焦磷酸酶原核表达载体的构建第44页
  3.2 pET-21a(+)密码子系列无机焦磷酸酶的表达分析第44-46页
4 PBAD表达系统下密码子调控元件对无机焦磷酸酶表达的影响第46-50页
  4.1 pBAD系统下不同密码子系列无机焦磷酸酶的扩增第46-47页
  4.2 pBAD系统下不同密码子系列无机焦磷酸酶原核表达载体的构建第47-48页
  4.3 pBAD表达系统下不同密码子无机焦磷酸酶的表达分析第48-49页
  4.4 pBAD表达系统下不同密码子无机焦磷酸酶的相对活性分析第49-50页
5 不同的蛋白(B-葡萄糖苷酶)在密码子调控元件下的表达情况第50-55页
  5.1 不同密码子系列β-葡萄糖苷酶PCR扩增第50页
  5.2 不同密码子系列β-葡萄糖苷酶原核表达载体的构建第50-51页
  5.3 不同密码子调控元件下β-葡萄糖苷酶表达分析第51-54页
  5.4 不同密码子调控元件下β-葡萄糖苷酶相对活性分析第54-55页
6 密码子调控元件在代谢途径改造上的应用第55-58页
  6.1 不同密码子系列IspG的PCR扩增第55-56页
  6.2 不同密码子系列IspG原核表达载体的构建第56页
  6.3 不同表达水平IspG对MEP途径的影响第56-58页
7 讨论第58-61页
第四章 本研究的主要结论第61-62页
参考文献第62-71页
附录1 部分试剂药品配方第71-73页
附录2 缩略词第73-74页
致谢第74页

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