基于序列顺序信息的DNA结合蛋白识别与远程同源性检测

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基于序列顺序信息的DNA结合蛋白识别与远程同源性检测

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基于序列顺序信息的DNA结合蛋白识别与远程同源性检测

论文目录
摘要	第1-6页
ABSTRACT	第6-10页
第1章绪论	第10-20页
1.1 课题背景	第10-11页
1.2 研究目的及意义	第11-13页
1.3 国内外相关技术发展现状	第13-16页
1.3.1 DNA结合蛋白识别研究现状	第13-14页
1.3.2 蛋白质远程同源性检测研究现状	第14-16页
1.4 本文的主要研究内容和内容安排	第16-20页
1.4.1 主要研究内容	第16-18页
1.4.2 本文内容安排	第18-20页
第2章基于伪氨基酸组成的DNA结合蛋白识别方法	第20-32页
2.1 引言	第20页
2.2 伪氨基酸组成	第20-21页
2.3 氨基酸索引数据库	第21页
2.4 预测方法	第21-28页
2.4.1 全局氨基酸组成（OAAC）	第21-22页
2.4.2 伪氨基酸组成（Pse AAC）	第22-23页
2.4.3 氨基酸物理化学距离转换（PDT）	第23-24页
2.4.4 基于三种序列特征的向量化方法	第24-26页
2.4.5 分类模型建立	第26-27页
2.4.6 留一评价方法	第27-28页
2.5 实验结果与分析	第28-31页
2.5.1 DNA结合蛋白数据集	第28-29页
2.5.2 性能评价指标	第29页
2.5.3 性能评估	第29-31页
2.6 本章小结	第31-32页
第3章基于距离对和缩减字母表的DNA结合蛋白识别方法	第32-45页
3.1 引言	第32页
3.2 距离对	第32-33页
3.3 预测方法	第33-37页
3.3.1 蛋白质向量化方法	第33-37页
3.3.2 分类模型和评价	第37页
3.4 实验结果与分析	第37-43页
3.4.1 DNA结合蛋白数据集	第37-38页
3.4.2 性能评价指标	第38-39页
3.4.3 性能评估	第39-43页
3.5 本章小结	第43-45页
第4章基于距离对的蛋白质远程同源性检测方法	第45-54页
4.1 引言	第45页
4.2 Top-n-gram距离对	第45-46页
4.3 预测方法	第46-48页
4.3.1 蛋白质向量化方法	第46-48页
4.3.2 分类模型建立	第48页
4.4 实验结果与分析	第48-53页
4.4.1 同源性检测数据集	第48-49页
4.4.2 ROC分数指标	第49页
4.4.3 性能评估	第49-53页
4.5 本章小结	第53-54页
第5章基于距离对伪氨基酸组成的蛋白质远程同源性检测方法	第54-64页
5.1 引言	第54页
5.2 距离对伪氨基酸组成	第54-55页
5.3 预测方法	第55-59页
5.3.1 蛋白质向量化方法	第55-58页
5.3.2 主成分分析	第58-59页
5.4 实验结果与分析	第59-63页
5.4.1 分类模型和数据集	第59页
5.4.2 性能评估	第59-63页
5.5 本章小结	第63-64页
结论	第64-66页
参考文献	第66-75页
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果	第75-77页
致谢	第77页

本篇论文共77页，点击这进入下载页面。

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