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蛋白质构象运动的结构分析和动力学研究
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蛋白质构象运动的结构分析和动力学研究
论文目录
摘要
第1-6页
abstract
第6-14页
第一章 蛋白质基本结构及其动力学
第14-28页
1.1 蛋白质基本结构
第14-18页
1.1.1 氨基酸和肽键
第14-16页
1.1.2 蛋白质的一级结构
第16页
1.1.3 蛋白质的二级结构
第16-17页
1.1.4 蛋白质的三级结构及四级结构
第17-18页
1.2 蛋白质中的相互作用
第18-20页
1.2.1 蛋白质内部的相互作用
第18-20页
1.2.2 蛋白质与周围溶剂的相互作用
第20页
1.3 蛋白质的研究模型
第20-23页
1.3.1 蛋白质结构模型
第20-21页
1.3.2 蛋白质模型中的相互作用
第21-23页
1.4 蛋白质的动力学
第23-26页
1.4.1 蛋白质系统的自由能面
第23-24页
1.4.2 不同时空尺度的蛋白质运动
第24-26页
1.5 本文的研究内容
第26-28页
第二章 利用信号网络模型识别蛋白的hinge位点
第28-42页
2.1 引言
第28页
2.2 模型和方法
第28-34页
2.2.1 信号传导模型
第28-30页
2.2.2 残基距离的定义
第30-31页
2.2.3 分析距离矩阵
第31-33页
2.2.4 测试数据集
第33-34页
2.2.5 作为对比的识别方法
第34页
2.3 计算结果
第34-39页
2.3.1 HAG测试组的计算结果
第34页
2.3.2 预测结果分类统计
第34-37页
2.3.3 特定蛋白内可能的hinge位点
第37-39页
2.4 总结
第39-42页
第三章 甘氨酸插入对黄色荧光蛋白氯离子通道的影响
第42-58页
3.1 引言
第42-44页
3.2 模型与方法
第44-46页
3.2.1 蛋白结构
第44页
3.2.2 模拟步骤
第44-46页
3.3 计算结果
第46-53页
3.3.1 YFP和YFP+的平衡模拟结果
第46-49页
3.3.2 TLES的模拟结果
第49-53页
3.4 总结
第53-58页
第四章 总结和展望
第58-60页
参考文献
第60-66页
科研成果
第66-68页
致谢
第68-69页
本篇论文共
69
页,
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。
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