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斑马鱼生长抑素-1基因靶向敲降和营救以及基于表达谱的胚胎发育功能分析

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斑马鱼生长抑素-1基因靶向敲降和营救以及基于表达谱的胚胎发育功能分析
论文目录
 
摘要第1-10页
Abstract第10-13页
第一章 文献综述第13-23页
  1.1 生长抑素在脊椎动物的进化第13-15页
    1.1.1 脊椎动物生长抑素的研究第13-14页
    1.1.2 脊椎动物SS的系统进化分析第14页
    1.1.3 六个SS基因在斑马鱼的不同组织的表达模式第14-15页
  1.2 SS家族多肽第15-17页
    1.2.1 SS1第15页
    1.2.2 SS2/CST第15-16页
    1.2.3 SS3第16页
    1.2.4 SS4第16页
    1.2.5 SS5第16-17页
    1.2.6 SS6第17页
    1.2.7 其他SS相关基因第17页
  1.3 SS家族受体第17-19页
    1.3.1 SS受体的特性第17-18页
    1.3.2 SS受体的进化第18-19页
  1.4 生长抑素功能第19-21页
    1.4.1 SS1功能第19-20页
    1.4.2 SS2/SCT功能第20-21页
    1.4.3 其他SS相关基因的功能第21页
  1.5 高通量基因表达谱的应用第21-23页
    1.5.1 数字基因表达谱的原理第21-22页
    1.5.2 数字基因表达谱的特点第22页
    1.5.3 数字基因表达谱的应用第22-23页
第二章 绪论第23-25页
  2.1 选题背景与意义第23页
  2.2 研究内容与技术路线第23-25页
    2.2.1 研究内容第23-24页
    2.2.2 技术路线第24-25页
第三章 实验材料与方法第25-37页
  3.1 材料和试剂第25-29页
    3.1.1 实验材料第25页
    3.1.2 菌种及质粒第25-26页
    3.1.3 主要试剂及酶类第26页
    3.1.4 主要试剂的配制第26-28页
    3.1.5 主要仪器第28-29页
  3.2 实验方法第29-37页
    3.2.1 MOs的合成引物设计第29页
    3.2.2 SS1表达质粒的构建第29-30页
    3.2.3 SS1 mRNA的体外转录及显微注射第30-33页
    3.2.4 斑马鱼胚胎总RNA的提取及检测第33页
    3.2.5 表达谱文库的构建及测序第33页
    3.2.6 表达谱测序数据的评估第33-34页
    3.2.7 基因表达水平分析第34页
    3.2.8 差异表达分析第34-35页
    3.2.9 差异基因GO富集分析第35页
    3.2.10 差异基因KEGG富集分析第35-37页
第四章 实验结果分析与讨论第37-63页
  4.1 实验结果第37-57页
    4.1.1 SS1 capped mRNA的体外转录第37页
    4.1.2 显微注射与表型分析第37-39页
    4.1.3 总RNA提取质量检测第39-40页
    4.1.4 DGE测序数据的产出和表达谱reads的注释第40-41页
    4.1.5 实验的可重复性第41-43页
    4.1.6 差异基因聚类分析第43-44页
    4.1.7 差异表达基因筛选第44-46页
    4.1.8 共有差异基因的筛选第46-57页
  4.2 讨论与分析第57-63页
    4.2.1 MOs和RNA营救实验在基因功能研究中的应用第57页
    4.2.2 高通量基因表达谱在基因功能研究中的应用第57-58页
    4.2.3 分析SS1在斑马鱼发育中的功能第58-63页
第五章 结论第63-65页
参考文献第65-75页
致谢第75-77页
攻读硕士学位期间发表论文及参与科研项目第77页

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