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鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传结构及mtDNA基因组全序列分析

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鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传结构及mtDNA基因组全序列分析
论文目录
 
摘要第1-5页
Abstract第5-11页
第一章 引言第11-19页
  1.1 放逸短沟蜷概述第11-13页
    1.1.1 繁殖与发育研究第11页
    1.1.2 寄生虫研究第11-12页
    1.1.3 生态学研究第12页
    1.1.4 系统发育研究第12-13页
  1.2 鄱阳湖流域简介第13-15页
    1.2.1 鄱阳湖流域五河水系第13-14页
    1.2.2 鄱阳湖流域贝类生物多样性第14页
    1.2.3 鄱阳湖流域贝类生物多样性面临的威胁第14-15页
  1.3 软体动物 mtDNA 基因组第15-18页
    1.3.1 线粒体概述第15页
    1.3.2 软体动物 mtDNA 基因组全序列研究概况第15-16页
    1.3.3 软体动物 mtDNA 基因组结构组成第16-17页
    1.3.4 软体动物 mtDNA 基因组特性第17-18页
  1.4 研究目的和意义第18-19页
第二章 基于线粒体 COI 序列的鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传结构分析第19-37页
  2.1 材料与方法第19-25页
    2.1.1 放逸短沟蜷标本采集第19-22页
    2.1.2 放逸短沟蜷样品形态学鉴定第22页
    2.1.3 实验试剂与仪器第22页
    2.1.4 基因组 DNA 提取第22-23页
    2.1.5 基因组 DNA 浓度测定第23页
    2.1.6 COI 基因片段的 PCR 扩增第23-24页
    2.1.7 PCR 扩增产物的检测及测序第24页
    2.1.8 数据分析第24-25页
  2.2 实验结果第25-35页
    2.2.1 放逸短沟蜷基因组 DNA 浓度第25-26页
    2.2.2 PCR 产物电泳结果第26页
    2.2.3 序列比对结果第26-27页
    2.2.4 COI 序列特征第27页
    2.2.5 遗传多样性分析第27-29页
    2.2.6 遗传距离第29页
    2.2.7 系统发育树第29-31页
    2.2.8 群体间的遗传分化第31-32页
    2.2.9 种群历史动态第32-35页
  2.3 讨论第35-36页
    2.3.1 样本代表性第35页
    2.3.2 鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传多样性第35页
    2.3.3 鄱阳湖流域放逸短沟蜷群体遗传分化第35-36页
  2.4 小结第36-37页
第三章 放逸短沟蜷 mtDNA 基因组全序列分析第37-48页
  3.1 材料与方法第37-40页
    3.1.1 放逸短沟蜷样本来源第37页
    3.1.2 实验试剂与仪器第37页
    3.1.3 基因组 DNA 提取第37-38页
    3.1.4 基因组 DNA 的 PCR 扩增及测序第38-40页
    3.1.5 序列拼接和组装第40页
    3.1.6 基因注释和序列分析第40页
  3.2 实验结果第40-45页
    3.2.1 放逸短沟蜷 mtDNA 基因组结构和排列方式第40-43页
    3.2.2 放逸短沟蜷 mtDNA 基因组核苷酸组成第43页
    3.2.3 蛋白质编码基因及密码子使用情况第43-44页
    3.2.4 tRNA 和 rRNA 基因第44-45页
  3.3 讨论第45-46页
    3.3.1 放逸短沟蜷 mtDNA 基因组结构特点及基因排列方式第45页
    3.3.2 蟹守螺超科 mtDNA 基因组扩增存在的问题及解决方法第45-46页
  3.4 小结第46-48页
第四章 结论与展望第48-51页
  4.1 结论第48-49页
  4.2 展望第49-51页
致谢第51页
参考文献第51-57页
附录第57-59页
攻读学位期间的研究成果第59页

本篇论文共59页,点击这进入下载页面
 
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