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大豆再生相关的转录组分析及GmARF2基因的初步研究

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大豆再生相关的转录组分析及GmARF2基因的初步研究
论文目录
 
摘要第1-10页
英文摘要第10-12页
1 前言第12-26页
  1.1 国内外研究进展第12-25页
    1.1.1 植物激素与大豆再生的研究基础第12-13页
    1.1.2 植物激素对植物生长发育的研究第13-19页
    1.1.3 转录组测序技术第19-21页
    1.1.4 植物离体培养的理论基础第21-25页
  1.2 技术路线第25-26页
2 材料与方法第26-36页
  2.1 试验材料与仪器第26-27页
    2.1.1 植物材料第26页
    2.1.2 菌株以及载体第26页
    2.1.3 试剂第26页
    2.1.4 培养基第26-27页
    2.1.5 仪器第27页
  2.2 试验方法第27-36页
    2.2.1 外源 2,4-D浓度的筛选第27-28页
    2.2.2 大豆胚尖成活率的测定第28页
    2.2.3 生理指标测定第28页
    2.2.4 转录组测序第28-29页
    2.2.5 GmARF2基因的生物信息学分析第29-30页
    2.2.6 GmARF2基因的组织特异性表达分析第30页
    2.2.7 GmARF2基因的克隆及表达载体的构建第30-33页
    2.2.8 GmARF2基因对拟南芥的遗传转化第33-34页
    2.2.9 GmARF2基因对大豆的遗传转化第34-36页
3 结果与分析第36-60页
  3.1 生理指标测定及成活率结果及分析第36-41页
    3.1.1 不同浓度外源 2,4-D对大豆胚尖IAA活性影响第36-37页
    3.1.2 不同浓度外源 2,4-D对大豆胚尖超氧化物歧化酶活性的影响第37-38页
    3.1.3 不同浓度外源 2,4-D对大豆胚尖苯丙氨酸解氨酶活性影响第38-39页
    3.1.4 不同浓度 2,4-D处理下两品种大豆外植体成活率分析第39-40页
    3.1.5 相关性分析第40-41页
  3.2 转录组测序数据的分析第41-49页
    3.2.1 测序数据质量统计第41页
    3.2.2 clean data与参考基因组比对分析第41-43页
    3.2.3 clean data与参考基因组比对分布图第43页
    3.2.4 clean data与参考基因比对分析第43-44页
    3.2.5 差异表达基因分析第44页
    3.2.6 基因差异表达筛选第44-46页
    3.2.7 基因差异表达聚类分析第46-47页
    3.2.8 差异表达基因GO富集分析第47-48页
    3.2.9 差异表达基因PATHWAY富集分析第48-49页
    3.2.10 差异表达基因的获得第49页
  3.3 GmARF2基因的生物信息学分析第49-54页
    3.3.1 GmARF2的序列特征及启动子分析第49-50页
    3.3.2 GmARF2编码的蛋白质氨基酸功能分析第50页
    3.3.3 GmARF2编码的蛋白质的二级结构及三级结构分析第50-51页
    3.3.4 GmARF2编码的蛋白质的亲水性分析第51-52页
    3.3.5 GmARF2基因进化树分析第52-53页
    3.3.6 GmARF2所属KEGG通路分析第53页
    3.3.7 GmARF2基因在东农50中的组织特异性分析第53-54页
  3.4 GmARF2基因的克隆及载体构建第54-58页
    3.4.1 总RNA提取和检测结果第54页
    3.4.2 大豆GmARF2基因序列全长的获得第54-56页
    3.4.3 大豆GmARF2基因的克隆第56页
    3.4.4 大豆GmARF2基因的载体构建第56-58页
  3.5 GmARF2基因对拟南芥和大豆的遗传转化第58-60页
    3.5.1 GmARF2基因对拟南芥的遗传转化第58-59页
    3.5.2 GmARF2基因对大豆的遗传转化第59-60页
4 讨论第60-63页
  4.1 外源激素与再生相关指标的关系及筛选依据第60页
  4.2 转录组测序数据的分析第60-61页
  4.3 再生相关基因的获得第61页
  4.4 GmARF2基因的克隆、分析及功能预测第61-62页
  4.5 GmARF2对拟南芥和大豆的遗传转化第62-63页
5 结论第63-64页
致谢第64-65页
参考文献第65-73页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第73页

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