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基于转录组对茯苓菌核形成发育相关功能基因分析
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基于转录组对茯苓菌核形成发育相关功能基因分析
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
第一章 绪论第10-21页
　　1.1 茯苓概述第10-11页
　　　　1.1.1 茯苓的生物学特征第10-11页
　　　　1.1.2 茯苓的应用价值第11页
　　1.2 茯苓的研究现状第11-13页
　　1.3 生物信息学概述第13-18页
　　　　1.3.1 Illumina基本流程与原理第15-16页
　　　　1.3.2 数据应用及分析第16页
　　　　1.3.3 分子标记研究及应用第16-18页
　　1.4 QRT-PCR第18-19页
　　　　1.4.1 qRT-PCR原理第18页
　　　　1.4.2 qRT-PCR定量第18-19页
　　1.5 技术路线第19页
　　1.6 立题依据及意义第19-21页
第二章 实验材料和实验方法第21-30页
　　2.1 实验材料第21-23页
　　　　2.1.1 植物材料第21页
　　　　2.1.2 酶与试剂第21-22页
　　　　2.1.3 主要仪器和设备第22-23页
　　2.2 实验方法第23-30页
　　　　2.2.1 茯苓不同时期总RNA的提取及CDNA合成第23-25页
　　　　2.2.2 cDNA文库构建第25页
　　　　2.2.3 高通量测序第25-26页
　　　　2.2.4 Unigene功能注释第26-27页
　　　　2.2.5 Unigene表达丰度的计算第27页
　　　　2.2.6 基因表达量验证第27-30页
第三章 实验结果第30-44页
　　3.1 茯苓不同时期总RNA的提取第30页
　　3.2 转录组测序结果的产出，序列拼接和基因表达第30-31页
　　3.3 基因功能注释第31-38页
　　　　3.3.1 GO注释和分类第32-33页
　　　　3.3.2 KOG功能注释和分类第33-35页
　　　　3.3.3 KEGG代谢通路第35页
　　　　3.3.4 DEG分析第35-38页
　　3.4 基因表达量验证第38-44页
　　　　3.4.1 QRT-PCR体系的建立及优化第38-40页
　　　　3.4.2 候选基因引物设计第40-42页
　　　　3.4.3 内参筛选第42-43页
　　　　3.4.4 qRT-PCR基因表达量验证第43-44页
第四章 讨论第44-47页
　　4.1 RNA提取方法的改进第44页
　　4.2 茯苓菌核形成分析第44-45页
　　4.3 茯苓菌核发育分析第45-47页
结论第47-48页
参考文献第48-58页
致谢第58-59页
附录第59-67页
攻读学位期间的研究成果第67页

本篇论文共67页，点击这进入下载页面。
 
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