融合插入/缺失信息的DNA进化模型的改进

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融合插入/缺失信息的DNA进化模型的改进

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融合插入/缺失信息的DNA进化模型的改进

论文目录
摘要	第1-8页
Abstract	第8-9页
1 绪论	第9-23页
· 研究背景和意义	第9-12页
· 国内外研究现状	第12-21页
· 核苷酸置换模型	第13-18页
· 涉及indel的模型	第18-21页
· 本文的研究内容和结构	第21-23页
2 使用工具和技术路线	第23-26页
· 使用工具	第23-24页
· 技术路线	第24-26页
· 研究方法和技术	第24-25页
· 论文可行性分析	第25-26页
3 改进模型的构建	第26-33页
· JC69+gap'模型	第28-29页
· F81+gap'模型	第29-30页
· HKY85+gap'模型	第30-31页
· F84+gap'模型	第31-33页
4 结果与分析	第33-62页
· 测试数据	第33-37页
· 真实DNA序列的选取	第33-34页
· 模拟DNA序列的产生	第34-37页
· 方法	第37-41页
· 最大似然法	第37-39页
· 遗传算法	第39-41页
· 真实数据的结果与分析	第41-51页
· 测试结果	第41-46页
· 检验分析	第46-51页
· 模拟数据的结果与分析	第51-62页
5 小结	第62-63页
6 展望	第63-64页
参考文献	第64-68页
附录A：模型的置换概率矩阵的推导过程	第68-70页
附录B：JC69+gap’模型的距离公式推导	第70-72页
附录C：F81+gap’模型的距离公式推导	第72-74页
附录D：计算机模拟序列的多序列比对数据	第74-85页
致谢	第85页

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