两种淡水蚌抗旱反应的转录组差异分析

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两种淡水蚌抗旱反应的转录组差异分析

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两种淡水蚌抗旱反应的转录组差异分析

论文目录
上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单	第1-4页
摘要	第4-5页
ABSTRACT	第5-9页
第一章引言	第9-16页
· 研究背景	第9页
· 贝类对干旱的反应	第9-10页
· 海洋贝类的表达研究	第10-11页
· 下一代测序研究	第11-12页
· 甲壳动物的热休克蛋白反应	第12-14页
· 论文研究目的意义	第14-16页
第二章淡水蚌 P. grandis 转录组高通量测序及分析	第16-23页
1 前言	第16页
2 材料与方法	第16-19页
· 实验动物和组织采样	第16-17页
· RNA 提取、文库构建和测序	第17-18页
· 测序序列的从头组装	第18-19页
· 基因注释和本体论	第19页
3 结果与分析	第19-23页
· 斧足组织短表达序列的测序	第19-20页
· 转录组的从头组装	第20-21页
· 基因鉴定和注释	第21-23页
第三章淡水蚌 U. tetralasmus 转录组高通量测序及分析	第23-28页
1 前言	第23页
2 材料与方法	第23-24页
· 实验动物和组织采样	第23-24页
· RNA 提取、文库构建和测序	第24页
· 测序序列的从头组装	第24页
· 基因注释和本体论	第24页
3 结果与分析	第24-28页
· 斧足组织短表达序列的测序	第24-25页
· 转录组的从头组装	第25-26页
· 基因鉴定和注释	第26-28页
第四章两种淡水蚌 P.grandis 和 U. tetralasmus 的不同抗旱反应的转录组比较与分析	第28-50页
1 前言	第28-29页
2 材料与方法	第29-32页
· 差异表达片段的鉴定	第29页
· 基因本体论和富集分析	第29-30页
· 实验验证—QPCR	第30-31页
· 关键基因的时相表达分析	第31-32页
3 结果	第32-43页
· 差异表达基因的鉴定和分析	第32-33页
· 富集和通路分析	第33-40页
· QPCR 验证 RNA-seq 分析	第40-42页
· 关键热/干燥相关基因的时相表达	第42-43页
4 讨论	第43-48页
· 伴侣蛋白/热休克蛋白	第45-46页
· 抗氧化/氧化应激反应	第46页
· 细胞增殖/细胞凋亡	第46-47页
· 免疫	第47页
· 细胞骨架	第47-48页
· 其它	第48页
5 研究展望	第48-50页
· 时间点分析	第48页
· 个体变异和物种变异	第48-49页
· 组织变异性	第49页
· 测定的一致性	第49-50页
结论	第50-51页
参考文献	第51-60页
附录	第60-61页
致谢	第61 页

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