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广西HP-PRRSV流行毒株遗传进化研究

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广西HP-PRRSV流行毒株遗传进化研究
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-11页
目录第11-13页
缩略词表第13-14页
第一章 前言第14-22页
  · 猪繁殖与呼吸综合征概述第14-15页
  · 病原学第15-16页
  · 基因组结构第16-17页
  · 流行病学第17-18页
  · 基因多样性及变异性第18-19页
  · 致病机理第19-20页
  · 研究的目的及意义第20-21页
  · 技术路线第21-22页
第二章 HP-PRRSV广西地方株分离鉴定及其基因组分子特征分析第22-50页
  · 材料第22-23页
    · 主要仪器设备第22页
    · 主要试剂及耗材第22页
    · 细胞第22-23页
    · 血清第23页
    · 病料第23页
    · 分子生物学软件第23页
  · 方法第23-31页
    · 细胞培养液的配制第23页
    · 病料采集及处理第23-24页
    · 引物设计第24-25页
    · 细胞培养与病毒分离第25-26页
    · 细胞病毒液的检测及鉴定第26-28页
    · PRRSV分离株的全基因组扩增、克隆和测序第28-30页
    · 序列比对分析第30-31页
  · 结果与分析第31-46页
    · PRRSV病毒分离及鉴定第31-34页
    · PRRSV全基因组的扩增结果第34-35页
    · 全基因组序列的拼接第35-36页
    · PRRSV分离株基因组序列同源性分析第36-42页
    · PRRSV分离株基因组核苷酸及氨基酸序列比对分析第42-45页
    · PRRSV分离株遗传进化分析第45-46页
  · 讨论第46-50页
    · 广西地区HP-PRRSV分离株的遗传进化分析第47-48页
    · 广西地区HP-PRRSV分离株的主要氨基酸位点及抗原表位分析第48-50页
第三章 免疫压力下HP-PRRSV田间流行毒株遗传进化研究第50-73页
  · 材料第50-51页
    · 主要仪器设备第50页
    · 主要试剂及耗材第50页
    · 猪场的选定第50页
    · 分子生物学软件第50-51页
  · 方法第51-55页
    · 组织病料及血清样品的采集第51页
    · 四个猪场血清PRRSV抗体检测第51页
    · 病料处理第51页
    · 引物设计第51-52页
    · 处理样品中病毒RNA的提取第52页
    · PRRSV RT-PCR的检测第52-53页
    · Nsp2及ORF567全长的扩增及测序第53-55页
    · 序列比对分析第55页
  · 结果与分析第55-69页
    · 四个猪场血清PRRSV抗体监测结果第55-58页
    · 血清及病料的RT-PCR检测第58-59页
    · Nsp2和ORF567的扩增第59-60页
    · Nsp2基因序列的同源性分析第60-61页
    · ORF5基因序列的同源性分析第61-62页
    · ORF6基因序列的同源性分析第62-63页
    · ORF7基因序列的同源性分析第63-65页
    · Nsp2、ORF5、ORF6、ORF7基因核苷酸进化树分析第65-66页
    · 基于Nsp2、ORF5、ORF6和ORF7基因的进化速率分析第66-69页
  · 讨论第69-73页
    · 定点监测猪场的流行病学分析第70页
    · Nsp2、ORF5、ORF6和ORF7基因序列分析结果第70-71页
    · 基于Nsp2、ORF5、ORF6和ORF7的进化速率分析第71-73页
第四章 结论第73-74页
参考文献第74-84页
附录一第84-85页
附录二第85-86页
附录三第86-87页
附录四第87-88页
致谢第88-89页
攻读硕士学位期间发表的论文及专利情况第89 页

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