基于基因组重测序的玉米温热带自交系转座子特征分析

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基于基因组重测序的玉米温热带自交系转座子特征分析

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基于基因组重测序的玉米温热带自交系转座子特征分析

论文目录
摘要	第1-6页
Abstract	第6-11页
1 文献综述	第11-26页
· 转座子扩增对基因组大小和结构的影响	第13-14页
· 转座子影响基因组大小	第13页
· 转座子介导的染色体重排	第13-14页
· 转座子介导压力响应机制和生物体对环境改变的遗传适应性	第14-15页
· 转座子激活响应环境应答	第14页
· 转座子对环境适应性的影响	第14-15页
· 转座子的驯化	第15-26页
· 转座子驯化的揭示	第16-17页
· 驯化转座元件的结构多样性	第17-20页
· 完整转座酶基因和其他功能域相融合后产生的嵌合基因	第20-21页
· 转座子来源的功能基因的进化机制	第21-24页
· 转座子来源的功能基因在多样的生物学过程中的功能角色	第24-26页
· 基因调控功能	第24页
· 染色质相关因子	第24页
· 细胞凋亡相关功能	第24页
· 细胞周期的控制	第24-25页
· 介导转座的能力	第25-26页
2 研究目的与意义	第26-27页
3 材料与方法	第27-30页
· 研究材料与软件	第27-28页
· 植物材料和SNPs数据	第27页
· 主要软件及公共分析平台	第27-28页
· 研究方法	第28-30页
· B73基因组转座子扫描和分析	第28页
· 新插入的非参考基因组非冗余转座子筛选	第28页
· 参考基因组重组率计算	第28页
· 材料间转座子数量统计和分类	第28-29页
· 转座子分布特征分析	第29页
· 新鉴定转座子聚类分析	第29页
· 受转座子影响基因的KEGG分析和WEGO聚类	第29-30页
4 结果与分析	第30-42页
· 玉米自交系材料全基因组READS扫描和统计新鉴定转座子	第30-31页
· 新插入不同类型转座子在基因组的分布特征	第31-35页
· 聚类分析	第35-37页
· 温、热带材料间新鉴定转座子分布差异特征	第37-38页
· 新鉴定转座子对邻近基因影响和温、热带材料间基因差异分析	第38-42页
5 讨论	第42-47页
· 转座子插入偏好性与基因组重组	第42-43页
· 不同地理分布材料中转座元件对环境适应性的影响	第43-44页
· 转座子对下游基因的调控作用	第44-47页
6 参考文献	第47-55页
7 附件	第55-62页
8 致谢	第62页

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