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番茄根内生菌分离鉴定、功能特性及基因组学

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番茄根内生菌分离鉴定、功能特性及基因组学
论文目录
 
中文摘要第1-3页
ABSTRACT第3-5页
中文文摘第5-11页
绪论第11-25页
第一节 植物内生菌的菌群结构及其多样性第11-14页
  1.1 什么样的细菌能够被定义为植物内生菌第11页
  1.2 植物内生菌的菌群结构组成第11页
  1.3 植物内生菌的多样性第11-13页
    1.3.1 不同宿主植物内生菌的差异第12页
    1.3.2 不同根际土壤中植物内生菌的差异第12-13页
  1.4 番茄根内生菌菌群结构及多样性第13-14页
第二节 植物根内生菌的侵入与定殖第14-18页
  2.1 植物根内生菌的来源及与根际土壤菌的关系第14页
  2.2 植物内生菌的侵入与定植第14-17页
    2.2.1 吸附于植物根表面第14-15页
    2.2.2 侵入植物根第15页
    2.2.3 侵入植物皮层第15-16页
    2.2.4 侵入植物木质部第16-17页
    2.2.5 侵染植物生殖器官第17页
  2.3 影响内生菌在根内定植的因素第17-18页
    2.3.1 内生菌自身性状对定植的影响第17页
    2.3.2 寄主植物类型对定植的影响第17-18页
    2.3.3 相关微生物对定植的影响第18页
    2.3.4 植物寄生线虫对定植的影响第18页
第三节 植物内生菌的功能第18-22页
  3.1 植物内生菌的防病害作用第18-20页
    3.1.1 植物内生菌的抑菌能力第18-19页
    3.1.2 竞争营养物质及生态位第19-20页
    3.1.3 诱导植物抗性第20页
  3.2 植物内生菌的促生长作用第20-21页
    3.2.1 植物内生菌的直接促生作用第21页
    3.2.2 植物内生菌的间接促生作用第21页
  3.3 植物内生菌的生物固氮作用第21-22页
第四节 研究内容、目的和意义第22-25页
  4.1 研究内容第22页
  4.2 研究目的及意义第22-25页
第一章 番茄根内生菌优势种群的分离、鉴定与多样性分析第25-37页
第一节 材料和方法第25-28页
  1.1 材料第25-26页
    1.1.1 样品采集与准备第25页
    1.1.2 培养基第25-26页
    1.1.3 主要仪器第26页
  1.2 方法第26-28页
    1.2.1 番茄根内生菌的分离纯化第26-27页
    1.2.2 总DNA的提取和质量检测第27页
    1.2.3 细菌16srRNA基因的PCR扩增第27页
    1.2.4 番茄根内生菌菌株的分子鉴定和系统发育分析第27-28页
第二节 结果和分析第28-34页
  2.1 表面消毒结果的检测第28页
  2.2 番茄根内生菌的分离纯化第28-29页
  2.3 细菌16SrRNA基因的PCR扩增与测序第29-34页
  2.4 16S rRNA序列比对及系统发育树的构建第34页
第三节 小结与讨论第34-37页
第二章 番茄根内生菌主要类群代表菌株基因组测序与功能分析第37-53页
第一节 材料和方法第37-38页
  1.1 方法第37-38页
    1.1.1 基因组测序第37-38页
    1.1.2 总DNA测序数据组装与功能注释第38页
第二节 结果和分析第38-51页
  2.1 总DNA测序数据组装与基因组功能注释第38-51页
    2.1.1 基因组的基本特征第38-39页
    2.1.2 基因组功能注释第39-45页
    2.1.3 次级代谢产物分析第45-51页
第三节 小结与讨论第51-53页
第三章 番茄根内生菌抑菌机制的研究第53-67页
第一节 材料与方法第53-55页
  1.1 实验材料第53-54页
    1.1.1 菌种第53页
    1.1.2 试剂第53-54页
    1.1.3 培养基第54页
  1.2 方法第54-55页
    1.2.1 番茄内生菌对细菌测试菌株的拮抗作用第54页
    1.2.2 番茄内生菌对真菌测试菌株黑曲霉的拮抗作用第54页
    1.2.3 p21抑菌活性与铁离子浓度关系的探究第54-55页
    1.2.4 p21次级代谢产物编码基因簇分析第55页
第二节 结果与分析第55-65页
  2.1 番茄内生菌对病原菌的拮抗作用第55-59页
  2.2 p21抑菌活性与铁离子浓度关系第59-61页
  2.3 p21次级代谢产物基因簇的AntiSMASH分析第61-63页
  2.4 p21中铁载体合成基因簇的分析第63-65页
第三节 小结与讨论第65-67页
第四章 木质纤维素酶在植物内生菌侵入定殖过程中作用的研究第67-81页
第一节 材料和方法第67-68页
  1.1 试剂和仪器第67-68页
    1.1.1 菌种第67页
    1.1.2 试剂第67-68页
    1.1.3 仪器第68页
  1.2 方法第68页
    1.2.1 纤维素酶活性定性分析第68页
    1.2.2 木聚糖酶活性定性分析第68页
    1.2.3 木质纤维素酶基因分析第68页
第二节 结果和分析第68-79页
  2.1 纤维素酶活性定性分析第68-72页
  2.2 木聚糖酶活性定性分析第72页
  2.3 优势菌木质纤维素酶基因分析第72-79页
第三节 小结与讨论第79-81页
第五章 总结与展望第81-85页
参考文献第85-97页
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果第97-99页
致谢第99-101页
个人简历第101-105页

本篇论文共105页,点击这进入下载页面
 
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