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翅碱蓬根系微生物群落多样性及其对降油细菌的负载性能研究

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翅碱蓬根系微生物群落多样性及其对降油细菌的负载性能研究
论文目录
 
摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第一章 综述第10-16页
  1 翅碱蓬第10-11页
    · 翅碱蓬的简介第10页
    · 翅碱蓬在生态修复中的研究概况第10-11页
      · 翅碱蓬对重金属污染的修复第10页
      · 翅碱蓬对有机物污染物的修复第10-11页
      · 翅碱蓬对盐碱土的改良第11页
      · 翅碱蓬对盐碱土壤微生物的影响第11页
  2 根际微生物第11-12页
    · 植物根际微生物的概念及多样性研究第11-12页
    · 植物根际微生物的种类第12页
  3 植物内生菌第12-13页
    · 植物内生细菌的概念及多样性研究第12页
    · 植物内生菌的种类第12-13页
  4 植物根系微生物多样性的研究方法第13-15页
    · 传统的分离培养法第13页
    · 基于分子生物学技术的非培养法第13-15页
      · 随机扩增多态性DNA技术第13-14页
      · 聚合酶链式反应—单链构象多态性第14页
      · 末端限制性片段长度多态性第14页
      · 扩增r DNA限制性酶切片段分析第14页
      · 扩增片段长度多态性第14-15页
      · 变性/温度梯度凝胶电泳第15页
      · 高通量测序技术第15页
  5 本研究的目的及意义第15-16页
第二章 利用高通量测序方法分析翅碱蓬根系原核生物多样性第16-35页
  1 材料与方法第16-21页
    · 样品采集及处理第16-17页
    · 主要试剂第17页
    · 主要仪器设备第17页
    · 方法第17-19页
      · 样品总DNA的提取第17页
      · 提取DNA的PCR扩增第17-18页
      · 荧光定量第18页
      · Miseq文库构建第18页
      · Miseq测序第18-19页
    · 翅碱蓬根系及内生细菌生物信息学分析第19-21页
      · 样品原始数据的区分与统计第19页
      · 样品数据的优化与统计第19-20页
      · OTU聚类第20页
      · 稀释性曲线建立第20页
      · 多样性指数计算第20-21页
      · 分类学分析第21页
      · Shannon-Wiener曲线制作第21页
      · OTU分布Venn图制作第21页
      · 制作群落结构组分图第21页
      · Rank-Abundance曲线第21页
  2 结果第21-34页
    · 样品总DNA提取结果第21-23页
    · PCR扩增结果第23页
    · 数据结果统计第23-24页
    · 稀释性曲线第24-26页
    · 样品多样性指数结果统计第26-27页
    · Shannon-Wiener曲线第27-29页
    · OTU分布Venn图第29-30页
    · 群落结构组分图第30-32页
    · Rank-Abundance曲线第32-34页
  3 讨论第34-35页
第三章 翅碱蓬根系及根组织内可培养细菌多样性分析第35-44页
  1 材料与方法第35-36页
    · 样品采集与处理第35页
    · 主要试剂第35页
    · 主要设备第35-36页
  2 方法第36页
    · 样品的分离和纯化第36页
    · 菌株DNA的提取第36页
    · 16S r DNA的PCR扩增及测序第36页
  3 结果第36-43页
    · 菌株的分离纯化与测序分析第36-43页
  4 讨论第43-44页
第四章 翅碱蓬根系对降油细菌负载能力测定第44-50页
  1 材料方法第44-46页
    · 材料第44-45页
      · 主要材料第44-45页
      · 其他材料第45页
      · 试验器材第45页
    · 方法第45-46页
      · 翅碱蓬根系石油降解菌负载性能测定第45页
      · 水培实验观察翅碱蓬根系石油降解菌负载情况第45页
      · G12菌株在根系表面附着情况观察第45-46页
      · 根系石蜡切片第46页
  2 结果第46-48页
    · 最佳定植条件第46-47页
    · 水培条件下根系的革兰氏染色第47页
    · 翅碱蓬根系的石蜡切片第47-48页
  3 讨论第48-49页
  4 结论第49-50页
参考文献第50-54页
攻读硕士学位期间参与的研究项目与发表的论文第54-55页
致谢第55-56页

本篇论文共56页,点击这进入下载页面
 
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