线虫和水稻中环状RNA的预测及分析

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线虫和水稻中环状RNA的预测及分析

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线虫和水稻中环状RNA的预测及分析

论文目录
摘要	第1-7页
Abstract	第7-9页
缩略词表	第9-10页
1 前言	第10-19页
· 环状RNA简介	第10-15页
· 环状RNA的生物起源	第11-13页
· 环状RNA的特征	第13页
· 环状RNA的功能	第13-15页
· 环状RNA的建库方式	第15页
· 环状RNA的预测方法	第15-17页
· miRNA结合方式	第17-18页
· 研究的目的与意义	第18-19页
2 材料与方法	第19-26页
· 数据来源和生物信息学工具	第19-21页
· RNA-seq数据来源	第19-20页
· microRNA数据来源	第20页
· 参考基因组以及基因组注释信息来源	第20页
· 生物信息学工具	第20-21页
· 数据分析方法	第21-26页
· 数据预处理	第21-22页
· 环状RNA的预测	第22-24页
· 表达量统计	第24页
· miRNA结合位点统计	第24-25页
· GO富集和表达模式聚类	第25页
· 内含子反向互补配对	第25-26页
3 结果与分析	第26-39页
· 线虫环状RNA分析	第26-34页
· 线虫环状RNA的基本特征	第26-28页
· RNase R对环状RNA的作用	第28-30页
· 环状RNA的多样性和可选择性	第30-31页
· 线虫环状RNA侧翼内含子特征	第31-32页
· miRNA在环状RNA上的结合位点	第32-33页
· GO富集和表达模式聚类	第33-34页
· 植物环状RNA分析	第34-39页
· 水稻环状RNA的基本特征	第34-36页
· 水稻环状RNA侧翼内含子特征	第36-37页
· 拟南芥环状RNA的基本特征	第37-39页
4 讨论	第39-41页
5 展望	第41-42页
参考文献	第42-48页
附录	第48-57页
附录I：水稻环状RNA	第48-56页
附录II：拟南芥环状RNA	第56-57页
致谢	第57页

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