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基于单双链复合体策略的肠道菌群分析方法的构建与应用

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基于单双链复合体策略的肠道菌群分析方法的构建与应用
论文目录
 
中文摘要第1-4页
ABSTRACT第4-9页
第一章 绪论第9-13页
  1.1 茶与肠道菌群的概述第9页
  1.2 微生态检测方法概述第9-10页
    1.2.1 菌群微生态研究的经典方法第10页
    1.2.2 菌群微生态研究的分子生物学方法第10页
  1.3 DGGE技术第10-12页
    1.3.1 DGGE技术用于微生态检测的优点第11页
    1.3.2 DGGE技术用于微生态检测的缺点第11-12页
  1.4 课题的目的和意义第12页
  1.5 主要研究内容第12-13页
第二章 小鼠肠道菌群16S RDNA PCR-DGGE分析第13-27页
  2.1 材料与设备第14-17页
    2.1.1 实验样品第14页
    2.1.2 引物信息第14-15页
    2.1.3 主要药品和试剂第15-16页
    2.1.4 主要仪器和设备第16-17页
  2.2 实验方法第17-20页
    2.2.1 细菌16S rDNA V3可变区PCR扩增第17-18页
    2.2.2 细菌16S rDNA V3可变区的DGGE分析第18页
    2.2.3 细菌16S rDNA V3可变区DGGE条带割胶回收及克隆测序第18-20页
      2.2.3.1 DGGE优势条带割胶回收及纯化第18页
      2.2.3.2 纯化DNA的连接第18-19页
      2.2.3.3 感受态细胞的制备第19页
      2.2.3.4 转化第19页
      2.2.3.5 阳性克隆的随机验证第19-20页
      2.2.3.6 阳性克隆的测序分析第20页
  2.3 结果与讨论第20-25页
    2.3.1 细菌16S rDNA V3可变区PCR扩增第20页
    2.3.2 细菌16S rDNA V3区的DGGE分析第20-25页
  2.4 本章小结第25-27页
第三章 基于单双链复合体策略的肠道拟杆菌解析第27-43页
  3.1 材料与设备第28-29页
    3.1.1 实验材料第28页
    3.1.2 引物信息第28页
    3.1.3 主要药品和试剂第28页
    3.1.4 主要仪器和设备第28-29页
  3.2 实验方法第29-32页
    3.2.1 拟杆菌属特异性16S rDNA V3可变区DGGE解析第29-30页
      3.2.1.1 拟杆菌特异性16S rDNA V3可变区的扩增第29-30页
      3.2.1.2 拟杆菌特异性16S rDNA V3可变区的DGGE条件优化第30页
      3.2.1.3 拟杆菌特异性16S rDNA V3可变区的DGGE条带割胶回收及克隆测序第30页
    3.2.2 拟杆菌特异性单双链复合体SDSC-Bac的构建及验证第30-32页
      3.2.2.1 拟杆菌特异性单双链复合体SDSC-Bac的构建第30-31页
      3.2.2.2 SDSC构建过程条件优化第31-32页
    3.2.3 拟杆菌特异性SDSC-Bac的DGGE解析第32页
  3.3 结果与讨论第32-41页
    3.3.1 拟杆菌属特异性16S rDNA V3可变区DGGE解析结果分析第32-36页
      3.3.1.1 拟杆菌特异性16S rDNA V3可变区扩增第32-33页
      3.3.1.2 拟杆菌特异性16S rDNA V3可变区的DGGE结果第33-36页
    3.3.2 拟杆菌特异性单双链复合体的构建及验证结果分析第36-38页
      3.3.2.1 拟杆菌特异性单双链复合体SDSC-Bac的构建及验证第36-37页
      3.3.2.2 单双链复合体构建过程条件优化第37-38页
    3.3.3 拟杆菌特异性SDSC-Bac的DGGE解析第38-41页
  3.4 本章小结第41-43页
第四章 基于单双链复合体策略的肠道乳酸菌解析第43-51页
  4.1 材料与设备第43-44页
    4.1.1 实验材料第43页
    4.1.2 引物信息第43-44页
    4.1.3 主要药品和试剂第44页
    4.1.4 主要仪器和设备第44页
  4.2 实验方法第44-45页
    4.2.1 乳酸菌属特异性V3区DGGE解析第44-45页
      4.2.1.1 乳酸菌特异性可变区的扩增第44-45页
      4.2.1.2 乳酸菌特异性可变区的DGGE条件优化第45页
      4.2.1.2 乳酸菌特异性可变区的DGGE条带割胶回收及克隆测序第45页
    4.2.2 乳酸菌特异性单双链复合体SDSC-Lac的构建及验证第45页
    4.2.3 乳酸菌特异性单双链复合体SDSC-Lac的DGGE解析第45页
  4.3 结果与讨论第45-49页
    4.3.1 乳酸菌特异性片段DGGE结果解析第45-47页
    4.3.2 乳酸菌特异性单双链复合体的构建及验证结果分析第47-48页
    4.3.3 乳酸菌特异性SDSC的DGGE解析第48-49页
  4.4 本章小结第49-51页
结论与展望第51-53页
结论第51-52页
展望第52-53页
参考文献第53-59页
致谢第59-60页
个人简介第60页

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