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基于RNA-Seq的小麦高密度遗传图谱构建和产量性状QTL分析
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基于RNA-Seq的小麦高密度遗传图谱构建和产量性状QTL分析
论文目录
 
符号说明第1-7页
中文摘要第7-9页
Abstract第9-10页
1.引言第10-17页
　　1.1 高通量测序技术第10-12页
　　　　1.1.1 全基因组测序第10-11页
　　　　1.1.2 基因组重测序第11页
　　　　1.1.3 转录组测序第11-12页
　　1.2 小麦基因组测序第12-13页
　　1.3 小麦遗传图谱构建第13-14页
　　1.4 小麦产量和籽粒性状QTL分析第14-16页
　　　　1.4.1 小麦产量性状QTL第14-15页
　　　　1.4.2 小麦籽粒性状QTL第15-16页
　　1.5 本研究的目的意义第16-17页
2.材料与方法第17-21页
　　2.1 试验材料第17页
　　2.2 表型数据第17-18页
　　2.3 RNA-Seq分析第18-19页
　　　　2.3.1 取样第18页
　　　　2.3.2 总RNA提取和质量检测第18页
　　　　2.3.3 测序文库构建和上机测序第18页
　　　　2.3.4 数据质量控制第18-19页
　　2.4 转录组组装及变异分析第19-20页
　　　　2.4.1 转录组组装第19页
　　　　2.4.2 组装评估第19页
　　　　2.4.3 变异分析第19-20页
　　2.5 遗传图谱构建和QTL分析第20-21页
3.结果与分析第21-49页
　　3.1 亲本转录组组装第21-23页
　　　　3.1.1 亲本测序数据质量评估第21页
　　　　3.1.2 亲本比对结果第21页
　　　　3.1.3 亲本转录组组装结果第21-23页
　　　　3.1.4 亲本未比对reads的无参组装第23页
　　3.2 变异位点分析第23-24页
　　　　3.2.1 测序数据质量评估及比对结果分析第23-24页
　　　　3.2.2 SNP/INDEL基因型整合与注释第24页
　　3.3 遗传图谱构建第24-35页
　　3.4 QTL分析第35-49页
　　　　3.4.1 产量及其构成因素的RHF-QTL第45页
　　　　3.4.2 株高和穗部性状的RHF-QTL第45-47页
　　　　3.4.3 籽粒大小性状的RHF-QTL第47-49页
4.讨论第49-51页
　　4.1 高密度遗传图谱构建第49页
　　4.2 产量相关性状的QTL第49-51页
5.结论第51-53页
参考文献第53-60页
附录第60-73页
致谢第73页

本篇论文共73页，点击这进入下载页面。
 
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