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基于SSR标记及ITS、cpDNA序列的刺梨遗传多样性分析

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基于SSR标记及ITS、cpDNA序列的刺梨遗传多样性分析
论文目录
 
摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
1 前言第10-21页
  1.1 前人研究进展第10-20页
    1.1.1 遗传多样性研究概述第10-13页
      1.1.1.1 遗传多样性简介第10页
      1.1.1.2 遗传多样性的研究方法第10-11页
      1.1.1.3 遗传结构及其影响因素第11-13页
    1.1.2 SSR分子标记研究及应用第13-15页
      1.1.2.1 SSR标记简介第13-14页
      1.1.2.2 SSR标记的应用第14-15页
        1.1.2.2.1 遗传多样性的研究第14页
        1.1.2.2.2 遗传连锁图谱的构建第14-15页
        1.1.2.2.3 种质鉴定和品种分类第15页
        1.1.2.2.4 比较作图第15页
    1.1.3 ITS序列的研究及应用第15-17页
      1.1.3.1 ITS序列的特性第15-16页
      1.1.3.2 ITS序列在蔷薇科中的应用第16-17页
    1.1.4 叶绿体DNA(cpDNA)的研究及应用第17-18页
      1.1.4.1 叶绿体DNA(cpDNA)结构与特点第17页
      1.1.4.2 cpDNA序列在蔷薇科中的应用第17-18页
      1.1.4.3 cpDNA序列在亲缘地理学研究中的应用第18页
    1.1.5 刺梨遗传多样性的研究进展第18-20页
      1.1.5.1 刺梨的野生种质资源及分布第18-19页
      1.1.5.2 刺梨遗传多样性研究第19-20页
  1.2 研究内容及目的意义第20-21页
    1.2.1 研究的主要内容第20页
      1.2.1.1 基于SSR标记的刺梨遗传多样性和遗传结构分析第20页
      1.2.1.2 刺梨ITS序列的多态性及其在遗传多样性分析中的应用第20页
      1.2.1.3 刺梨cpDNA序列的多态性及其亲缘地理学分析第20页
    1.2.2 研究的目的意义第20-21页
2 材料与方法第21-28页
  2.1 试验材料第21-22页
    2.1.1 遗传多样性分析试材第21-22页
    2.1.2 试验材料获取方式第22页
  2.2 试验设计与方法第22-25页
    2.2.1 SSR引物筛选第22-23页
    2.2.2 SSR标记的多态性比较及野生刺梨资源的遗传多样性分析第23页
    2.2.3 ITS序列的获得及野生刺梨资源的ITS序列多态性分析第23页
    2.2.4 cpDNA基因间隔区引物的筛选及cpDNA单倍型分析第23页
    2.2.5 DNA提取,PCR扩增,电泳检测及测序第23-25页
      2.2.5.1 DNA的提取第23-24页
      2.2.5.2 PCR扩增第24页
      2.2.5.3 电泳检测第24-25页
      2.2.5.4 测序第25页
  2.3 数据分析第25-28页
    2.3.1 SSR标记数据分析第25-26页
    2.3.2 ITS单倍型数据分析第26页
    2.3.3 cpDNA单倍型数据分析第26-28页
3 结果与分析第28-67页
  3.1 SSR标记数据与分析第28-49页
    3.1.1 SSR扩增结果第28-32页
      3.1.1.1 SSR引物筛选第28-29页
      3.1.1.2 EST-SSR扩增结果第29-31页
      3.1.1.3 nSSR扩增结果第31-32页
    3.1.2 群体遗传多样性分析第32-46页
      3.1.2.1 基于EST-SSR群体遗传多样性分析第32-37页
      3.1.2.2 基于nSSR群体遗传多样性分析第37-41页
      3.1.2.3 基于SSR群体遗传多样性分析第41-46页
    3.1.3 群体遗传结构分析第46-49页
  3.2 ITS序列多态性分析第49-56页
    3.2.1 ITS的多态性分析第49-52页
    3.2.2 群体遗传多样性分析第52-53页
    3.2.3 群体遗传结构分析第53-55页
    3.2.4 群体历史事件分析第55-56页
  3.3 cpDNA单倍型分析第56-67页
    3.3.1 cpDNA引物筛选第56页
    3.3.2 cpDNA单倍型的多态性分析第56-59页
    3.3.3 群体遗传多样性分析第59-60页
    3.3.4 群体遗传结构分析第60-61页
    3.3.5 群体历史事件分析第61-66页
    3.3.6 花粉-种子迁移率第66-67页
4 讨论与结论第67-74页
  4.1 讨论第67-73页
    4.1.1 刺梨遗传多样性第67-69页
    4.1.2 刺梨遗传分化第69-70页
    4.1.3 刺梨遗传结构第70-71页
    4.1.4 亲缘地理学分析第71-72页
    4.1.5 刺梨保护策略第72-73页
  4.2 全文结论第73-74页
致谢第74-76页
参考文献第76-83页
缩略词表第83-84页
在读硕士期间发表的论文第84-85页
附录第85-92页

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