论文目录 | |
摘要 | 第1-8页 |
Abstract | 第8-10页 |
第一章 前言 | 第10-16页 |
1 单核苷酸多态性研究 | 第10-11页 |
2 FSHR和PDIA4基因多态性研究进展 | 第11-12页 |
3 猪繁殖性状SNP研究 | 第12-13页 |
4 SNP检测方法 | 第13-14页 |
5 从江香猪 | 第14-15页 |
6 研究目的及意义 | 第15-16页 |
第二章 材料与方法 | 第16-39页 |
1 实验材料与仪器试剂 | 第16-21页 |
1.1 实验材料 | 第16页 |
1.2 实验仪器 | 第16-17页 |
1.3 实验试剂 | 第17-19页 |
1.4 配制试剂 | 第19-21页 |
2 实验方法 | 第21-39页 |
2.1 DNA及RNA的提取与检测 | 第21-24页 |
2.2 Illumina Hiseq 2000 全基因组重测序及数据分析 | 第24-25页 |
2.3 AS-PCR及测序引物的设计与合成 | 第25-28页 |
2.4 PCR反应体系及程序 | 第28-29页 |
2.5 目的DNA片段的克隆与测序 | 第29-32页 |
2.6 AS-PCR检测SNP在香猪群体中的基因型 | 第32页 |
2.7 单倍型检测及构建 | 第32-34页 |
2.8 关联分析 | 第34-35页 |
2.9 PDIA4基因表达量检测 | 第35-36页 |
2.10 PDIA4编码蛋白Western Blot检测 | 第36-39页 |
第三章 结果 | 第39-85页 |
1 香猪繁殖性状统计 | 第39页 |
2 基因组DNA与RNA的提取结果 | 第39-40页 |
2.1 基因组DNA的提取结果 | 第39-40页 |
2.2 香猪子宫RNA的提取结果 | 第40页 |
3 候选SNP的AS-PCR校验结果 | 第40-49页 |
3.1 rs322800083位点的验证 | 第40-44页 |
3.2 rs81384737位点的验证 | 第44-46页 |
3.3 rs81211903位点的验证 | 第46-47页 |
3.4 rs331867016、rs343292829位点的验证 | 第47-49页 |
4 候选SNP的直接测序校验结果 | 第49-52页 |
4.1 rs695495204位点的验证 | 第49-50页 |
4.2 rs81216658位点的验证 | 第50-52页 |
5 FSHR和PDIA4基因外显子10的多态性结果 | 第52-81页 |
5.1 FSHR基因外显子10的多态性结果 | 第52-61页 |
5.2 PDIA4基因外显子10的多态性结果 | 第61-81页 |
6 香猪子宫PDIA4基因的m RNA表达水平 | 第81-83页 |
6.1 标准曲线的制备 | 第81-82页 |
6.2 PDIA4基因的mRNA表达水平 | 第82-83页 |
7 香猪子宫PDIA4编码蛋白的表达水平 | 第83-85页 |
第四章 讨论 | 第85-89页 |
1 FSHR基因外显子10的基因型频率及遗传特异性分析 | 第85页 |
2 FSHR基因外显子10基因多态性与香猪产仔数的相关分析 | 第85-86页 |
3 PDIA4基因外显子10的多态性及连锁不平衡分析 | 第86-87页 |
4 PDIA4基因rs81216658位点的密码子偏好性分析 | 第87页 |
5 PDIA4编码蛋白对猪繁殖性状的影响 | 第87-89页 |
第五章 结论 | 第89-90页 |
参考文献 | 第90-95页 |
致谢 | 第95-96页 |
附录 | 第96-103页 |
论文资助 | 第103页 |
在校期间已发表的文章 | 第103页 |
在校期间获得的奖励 | 第103-104页 |