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棉花nsLTP家族基因全基因组鉴定及其表达特征分析

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棉花nsLTP家族基因全基因组鉴定及其表达特征分析
论文目录
 
摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
本文所用主要缩略词第11-12页
第一部分 文献综述第12-28页
第一章 植物nsLTP基因家族研究进展第12-28页
1 nsLTP基因的系统分类第12-14页
2 nsLTP的结构特征第14-16页
3 植物中nsLTP基因的克隆、鉴定概况第16-19页
4 nsLTP基因的表达模式第19-20页
  4.1 nsLTP基因的时空表达特异性第19页
  4.2 nsLTP基因的逆境、激素诱导表达第19-20页
5 nsLTP基因的亚细胞定位第20-21页
6 nsLTP基因的生物学功能第21-24页
  6.1 nsLTP基因与非生物胁迫第21-22页
  6.2 nsLTP基因与生物胁迫第22页
  6.3 nsLTP基因与有性生殖第22-23页
  6.4 nsLTP基因与根瘤形成第23页
  6.5 nsLTP基因与信号转导第23-24页
  6.6 nsLTP基因与细胞生长第24页
  6.7 nsLTP基因与过敏反应第24页
7 nsLTP家族基因的进化第24-26页
8 棉花中nsLTP基因研究进展第26-28页
本研究的目的和意义第28-30页
第二部分 研究报告第30-68页
第二章 棉花中nsLTP家族基因的鉴定和分析第30-56页
1 材料与方法第30-32页
  1.1 基因组数据准备第30页
  1.2 棉花nsLTP家族基因鉴定流程第30-31页
  1.3 nsLTP序列分析第31页
  1.4 进化树重构第31页
  1.5 nsLTP重复基因分析第31-32页
  1.6 陆地棉nsLTP基因GO富集第32页
  1.7 陆地棉nsLTP基因启动子分析第32页
2 结果与分析第32-53页
  2.1 nsLTP基因系统分类统计第32-33页
  2.2 nsLTP基因分类ECM结构特征统计第33-34页
  2.3 棉花nsLTP同源命名第34-43页
  2.4 nsLTP基因家族重复基因分析第43-46页
  2.5 nsLTP家族基因进化树第46-47页
  2.6 已报道陆地棉nsLTP基因分析第47-49页
  2.7 陆地棉nsLTP基因GO富集分析第49-52页
  2.8 陆地棉顺式调控元件分析第52-53页
3 讨论第53-56页
  3.1 nsLTP家族基因的系统分类方法第53-54页
  3.2 nsLTP家族基因的进化组成第54-56页
第三章 陆地棉nsLTP基因表达分析及其验证第56-68页
1 材料与方法第56-58页
  1.1 植物材料第56页
  1.2 RNA提取和第一链cDNA合成第56-57页
  1.3 定量引物设计验证第57页
  1.4 实时荧光定量qRT-PCR分析第57-58页
  1.5 转录组数据分析方法第58页
2 结果与分析第58-66页
  2.1 nsLTP在陆地棉组织中表达分析第58-62页
  2.2 nsLTP基因在纤维突变体中表达分析第62-63页
  2.3 nsLTP在干旱、高盐胁迫下表达分析第63-66页
3 讨论第66-68页
  3.1 数据均一化方法选择第66-67页
  3.2 nsLTP基因系统分类和表达特征聚类第67页
  3.3 nsLTP基因表达特征分析验证第67-68页
全文结论第68-70页
参考文献第70-84页
附录第84-104页
致谢第104页

本篇论文共104页,点击这进入下载页面
 
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