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冬虫夏草菌的线粒体基因组测序及比较线粒体基因组学研究

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冬虫夏草菌的线粒体基因组测序及比较线粒体基因组学研究
论文目录
 
中文摘要第11-12页
ABSTRACT第12-15页
第一章 前言第15-19页
  1.1 线粒体基因组的研究概况第15-16页
    1.1.1 线粒体概述第15页
    1.1.2 真菌线粒体基因组的结构和特征第15-16页
  1.2 冬虫夏草概述第16-17页
    1.2.1 分类地位第16页
    1.2.2 研究进展第16-17页
  1.3 论文研究目的和意义第17页
  1.4 技术路线第17-19页
第二章 冬虫夏草菌线粒体基因组测序及注释分析第19-47页
  2.1 实验材料、仪器和试剂第19页
    2.1.1 实验材料第19页
    2.1.2 实验仪器第19页
    2.1.3 实验试剂第19页
  2.2 实验方法第19-25页
    2.2.1 实验试剂的配制第19-20页
    2.2.2 菌株的培养第20-21页
    2.2.3 菌株的保藏第21页
    2.2.4 DNA的提取方法第21-22页
    2.2.5 PCR引物设计第22-23页
    2.2.6 DNA片段的扩增第23页
    2.2.7 PCR产物的回收和纯化第23-24页
    2.2.8 基因克隆第24-25页
  2.3 测序及序列分析第25-26页
    2.3.1 测序方法第25页
    2.3.2 洌序结果的采集第25页
    2.3.3 序列组装与拼接第25页
    2.3.4 基因注释第25-26页
    2.3.5 序列分析第26页
  2.4 冬虫夏草菌与其他真菌的比较线粒体基因组学分析第26-28页
    2.4.1 基因组大小及tRNA基因的比较第26页
    2.4.2 PCG基因及rRNA基因顺序的比较第26-27页
    2.4.3 tRNA基因顺序的比较第27页
    2.4.4 内含子位置的比较第27-28页
    2.4.5 系谱分析第28页
  2.5 结果分析第28-47页
    2.5.1 冬虫夏草菌线粒体基因组的基本结构第28-29页
    2.5.2 PCG基因和rRNA基因的分析第29-34页
      2.5.2.1 碱基含量的分析第32-33页
      2.5.2.2 PCG基因中密码子使用情况分析第33-34页
      2.5.2.3 PCG基因中氨基酸使用情况分析第34页
    2.5.3 tRNA基因的分析第34-38页
    2.5.4 冬虫夏草菌线粒体基因组内含子的分析第38-39页
    2.5.5 冬虫夏草菌与肉座菌目真菌的比较线粒体基因组学研究第39-47页
      2.5.5.1 基因组大小及tRNA基因的比较第40-42页
      2.5.5.2 PCG基困及rRNA基因排列顺序的比较第42-43页
      2.5.5.3 tRNA基因顺序的比较第43-44页
      2.5.5.4 内含子位置的比较第44-45页
      2.5.5.5 系谱分析第45-47页
第三章 不同冬虫夏草菌株的比较线粒体基因组学研究第47-55页
  3.1 实验材料、仪器和试剂第47页
    3.1.1 实验材料第47页
    3.1.2 实验仪器第47页
    3.1.3 实验试剂第47页
  3.2 实验方法第47页
  3.3 测序及序列分析第47-49页
    3.3.1 测序方法第47-48页
    3.3.2 序列组装与拼接第48页
    3.3.3 基因注释第48页
    3.3.4 序列分析第48页
    3.3.5 系谱分析第48-49页
  3.4 结果分析第49-55页
    3.4.1 线粒体基因组组织结构的比较第49-50页
    3.4.2 线粒体基因组序列的比较第50-54页
    3.4.3 系谱分析第54-55页
第四章 总结第55-58页
参考文献第58-63页
攻读学位期间取得的研究成果第63-64页
致谢第64-66页
个人简况及联系方式第66-68页

本篇论文共68页,点击这进入下载页面
 
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