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绿针假单胞菌GP72中氧化应激调控因子OxyR的研究

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绿针假单胞菌GP72中氧化应激调控因子OxyR的研究
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-13页
第一章 背景介绍第13-23页
  · 植物根际促生细菌第13-15页
  · 假单胞菌的生物功能第15-17页
  · 吩嗪抗生素的作用机理第17-18页
  · 吩嗪与氧化应激的关系第18-21页
  1.5 OxyR 的研究进展第21-22页
  · 本研究的目的、意义和内容第22-23页
第二章 oxyR基因的克隆第23-33页
  · 实验材料第23-24页
    · 菌株、质粒与引物第23页
    2.1.2 酶类及DNA Marker第23-24页
    · 主要培养基第24页
    · 试验试剂第24页
  · 实验方法第24-29页
    2.2.1 GP72 基因组DNA的提取第24-25页
    · 聚合酶链式(PCR)反应第25-26页
    · 电泳定性检验DNA第26页
    · 产物的回收纯化第26-27页
    · DH5α感受态细胞的制备第27-28页
    · PCR产物连接克隆载体第28页
    · 感受态细胞转化第28页
    · 质粒提取第28-29页
    · 测序第29页
  · 实验结果第29-31页
    · oxyR基因的克隆第29-30页
    · OxyR调控子氨基酸序列比对第30-31页
  · 讨论与分析第31-33页
第三章 oxyR基因的突变、回补与过表达第33-41页
  · 实验材料第33-34页
    · 菌株、质粒与引物第33-34页
    3.1.2 酶类及DNA Marker第34页
    · 主要培养基第34页
    · 试验试剂第34页
  · 实验方法第34-36页
    · PCR扩增基因第34-35页
    · 酶切,连接第35-36页
    · 双亲杂交第36页
  · 实验结果第36-40页
    3.3.1 体外突变质粒pEXoxyRaacC1 的获得第36-38页
    · 双亲杂交获得oxyR基因突变株第38-39页
    · 体外过表达回补质粒pMEoxyR的获得第39-40页
    · 获得oxyR基因回补菌株与表达菌株第40页
  · 讨论与分析第40-41页
第四章 突变株的生长、表型改变与产物变化第41-51页
  · 实验材料第41-42页
    · 实验菌株第41页
    · 主要培养基第41-42页
    · 实验试剂第42页
  · 实验方法第42-44页
    · 菌体生长曲线测定第42页
    · 菌株的发酵培养条件第42-43页
    · 活性物质提取和测定方法第43页
    · 菌株运动性实验第43页
    · 菌株形态变化实验第43-44页
  · 实验结果第44-49页
    4.3.1 oxyR基因突变对于GP72 生长的影响第44-45页
    4.3.2 oxyR基因突变对于GP72 吩嗪产量的影响第45-46页
    4.3.3 oxyR基因突变对于GP72 存活能力的影响第46-48页
    4.3.4 oxyR基因突变对于GP72 运动性的影响第48页
    4.3.5 oxyR基因突变对于GP72 菌落形态的影响第48-49页
  · 讨论与分析第49-51页
第五章 突变株对常见氧化剂的反应第51-62页
  · 实验材料第51-52页
    · 实验菌株第51页
    · 主要培养基第51页
    · 实验试剂第51-52页
  · 实验方法第52-53页
    · 菌体生长曲线测定第52页
    · 氧化敏感性试验第52页
    · 生物膜实验第52-53页
  · 实验结果第53-59页
    · 固体平板上的氧化敏感性第53-55页
    · 液体培养基中对氧化剂的抗性第55-57页
    · 氧化应激下的生物膜变化第57-59页
  · 讨论与分析第59-62页
第六章 OxyR对相关基因调控的研究第62-70页
  · 实验材料第62-63页
    · 菌株与引物第62-63页
    6.1.2 酶类及DNA Marker第63页
    · 主要培养基第63页
    · 实验试剂第63页
  · 实验方法第63-66页
    · 提取总RNA第63-64页
    · 反转录第64-65页
    · 测定oxyR基因表达的转录物第65-66页
  · 实验结果第66-68页
    · 总RNA的提取第66-67页
    · 反转录得到cDNA第67页
    · qRT-PCR检测基因表达倍数的改变第67-68页
  · 讨论与分析第68-70页
第七章 总结与展望第70-73页
参考文献第73-83页
附录1 实验中所用的仪器设备第83-84页
附录2 GP72 菌株oxyR基因测序结果第84-87页
致谢第87-88页
攻读学位期间发表的学术论文第88 页

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