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利用牛肠道Faecalibacterium菌的16S rDNA基因对水体牛粪便污染源的检测方法研究
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利用牛肠道Faecalibacterium菌的16S rDNA基因对水体牛粪便污染源的检测方法研究
论文目录
 
中文摘要第1-5页
英文摘要第5-10页
1 绪论第10-21页
　　1.1 粪便污染第10页
　　1.2 牛粪便污染第10-12页
　　　　1.2.1 牛粪对空气的污染第11页
　　　　1.2.2 牛粪占用土地与对土壤的污染第11-12页
　　　　1.2.3 牛粪对环境水的污染第12页
　　1.3 牛粪便污染特征第12-13页
　　1.4 牛粪便污染的解决途径第13页
　　1.5 水体中粪便污染源的检测方法第13-17页
　　　　1.5.1 MST的指示物选择第14-15页
　　　　1.5.2 MST的源指示物检测方法第15-16页
　　　　1.5.3 MST的源解析方法第16-17页
　　1.6 检测水体粪便污染的新型指示菌第17-18页
　　1.7 粪便指示菌在水体中的稳定性研究第18-19页
　　1.8 研究目的、内容及技术路线第19页
　　1.9 研究创新点第19-21页
2 实验材料和方法第21-39页
　　2.1 实验耗材第21-25页
　　　　2.1.1 采集粪便样品第21页
　　　　2.1.2 采集污水样品第21-22页
　　　　2.1.3 实验试剂与耗材第22-23页
　　　　2.1.4 主要试剂盒第23页
　　　　2.1.5 主要仪器设备第23-24页
　　　　2.1.6 实验主要溶液及配制方法第24-25页
　　2.2 实验方法和步骤第25-39页
　　　　2.2.1 提取粪便样品基因组DNA第25-26页
　　　　2.2.2 粪便基因组DNA的验证第26-27页
　　　　2.2.3 高通量测序(454焦磷酸测序)第27页
　　　　2.2.4 高通量数据分析第27页
　　　　2.2.5 各物种间和牛粪便样品间的微生物多样性分析第27-28页
　　　　2.2.6 探究基因标记物特异性第28-29页
　　　　2.2.7 测定基因标记物阳性率第29页
　　　　2.2.8 确定基因标记物灵敏度第29-34页
　　　　2.2.9 基因标记物的实用性验证第34-35页
　　　　2.2.10 选择最适牛粪便基因标记物第35页
　　　　2.2.11 基因标记物稳定性及衰减规律的研究第35-39页
3 实验结果与分析第39-51页
　　3.1 基因组DNA的数据结果第39页
　　　　3.1.1 基因组DNA的数据结果分析第39页
　　3.2 微生物数据结果第39-44页
　　　　3.2.1 高通量测序结果第39-40页
　　　　3.2.2 不同物种肠道微生物多样性的结果第40-41页
　　　　3.2.3 不同物种肠道微生物多样性结果分析第41-42页
　　　　3.2.4 不同牛粪便样品的微生物多样性结果第42-44页
　　　　3.2.5 不同牛粪便样品的微生物多样性结果分析第44页
　　　　3.2.6 Faecalibacterium菌在各物种的比例结果第44页
　　3.3 基因标记物的确定第44-45页
　　　　3.3.1 初步选择基因标记物引物第44-45页
　　3.4 基因标记物特异性与阳性率结果第45-46页
　　　　3.4.1 特异性结果第45页
　　　　3.4.2 特异性结果分析第45-46页
　　　　3.4.3 阳性率结果第46页
　　　　3.4.4 阳性率结果分析第46页
　　3.5 基因标记物灵敏度与实用性结果第46-48页
　　　　3.5.1 重组质粒的测序检测第46页
　　　　3.5.2 连接转化实验讨论第46页
　　　　3.5.3 灵敏度结果第46-47页
　　　　3.5.4 灵敏度结果分析第47页
　　　　3.5.5 实用性结果第47页
　　　　3.5.6 实用性结果分析第47-48页
　　　　3.5.7 确定最适牛粪便基因标记物第48页
　　3.6 基因标记物稳定性探究结果第48-51页
　　　　3.6.1 水环境和温度对基因标记物稳定性的影响第48页
　　　　3.6.2 光照时间对基因标记物稳定性的影响第48-49页
　　　　3.6.3 基因标记物稳定性探究结果分析第49-51页
4 结论与展望第51-55页
　　4.1 总结第51-52页
　　4.2 讨论第52-53页
　　4.3 后续探究工作展望第53-55页
致谢第55-56页
参考文献第56-61页

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