远志鲨烯环氧酶基因克隆及其转录组研究

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远志鲨烯环氧酶基因克隆及其转录组研究

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远志鲨烯环氧酶基因克隆及其转录组研究

论文目录
摘要	第1-6页
ABSTRACT	第6-9页
符号说明	第9-14页
前言	第14-16页
第一章远志鲨烯环氧酶基因的克隆及序列分析研究	第16-50页
材料与方法	第16-33页
1 实验材料	第16-17页
1.1 植物材料	第16页
1.2 菌株和载体	第16页
1.3 酶和试剂	第16页
1.4 培养基类型	第16-17页
1.5 仪器及设备	第17页
2 实验方法	第17-33页
2.1 远志根总RNA的提取	第17-19页
2.2 cDNA第一链的合成	第19-20页
2.3 引物设计与合成	第20-21页
2.4 远志鲨烯环氧酶基因核心片段扩增	第21-22页
2.5 远志鲨烯环氧酶基因5'RACE扩增	第22-26页
2.6 远志鲨烯环氧酶基因3'RACE扩增	第26-29页
2.7 远志鲨烯环氧酶基因cDNA全长扩增	第29-32页
2.8 远志鲨烯环氧酶基因生物信息学分析	第32-33页
结果与讨论	第33-48页
1 远志总RNA的提取及质量检测	第33页
2 远志鲨烯环氧酶基因核心片段扩增与分析	第33-35页
3 远志鲨烯环氧酶基因5'RACE扩增与分析	第35-36页
4 远志鲨烯环氧酶基因3'RACE扩增与分析	第36-37页
5 远志鲨烯环氧酶基因全长序列拼接	第37页
6 远志鲨烯环氧酶基因全长序列扩增与分析	第37-38页
7 远志鲨烯环氧酶基因生物信息学分析	第38-48页
7.1 ORF分析及BLAST分析	第38-41页
7.2 蛋白基本理化性质及结构功能预测	第41-45页
7.3 ClustalX多重序列比对及系统进化树分析	第45-48页
小结	第48-50页
第二章鲨烯环氧酶基因对细叶远志皂苷含量影响研究	第50-64页
材料与方法	第50-56页
1 实验材料	第50-51页
1.1 植物材料	第50页
1.2 酶和试剂	第50页
1.3 仪器及设备	第50-51页
2 实验方法	第51-56页
2.1 细叶远志皂苷的含量测定	第51-53页
2.2 远志SE基因的表达分析	第53-55页
2.3 细叶远志皂苷含量与SE基因表达量相关分析	第55-56页
结果与讨论	第56-63页
1 方法学考察	第56-58页
1.1 线性范围考察	第56页
1.2 精密度试验	第56页
1.3 稳定性试验	第56页
1.4 重复性试验	第56页
1.5 加样回收率试验	第56-58页
2 细叶远志皂苷含量测定	第58-59页
3 远志总RNA的提取及质量检测	第59页
4 RT-qPCR熔解曲线与扩增曲线	第59-61页
4.1 熔解曲线	第59-60页
4.2 扩增曲线	第60-61页
5 远志SE基因相对表达量	第61-62页
6 细叶远志皂苷含量与SE基因表达量相关分析	第62-63页
小结	第63-64页
第三章基于转录组的远志皂苷生物合成关键酶基因挖掘研究	第64-81页
材料与方法	第64-67页
1 实验材料	第64-65页
1.1 植物材料	第64页
1.2 试剂	第64页
1.3 仪器及设备	第64-65页
2 实验方法	第65-67页
2.1 远志总RNA的提取	第65页
2.2 文库构建及Illumina测序	第65-66页
2.3 denovo组装	第66页
2.4 转录组的功能注释	第66-67页
结果与讨论	第67-80页
1 远志总RNA的提取及质量检测	第67-68页
2 从头组装	第68-69页
3 基因功能注释	第69-76页
3.1 NR库注释	第71-73页
3.2 GO注释	第73-74页
3.3 COG注释	第74-75页
3.4 KEGG注释	第75-76页
4 三萜皂苷生物合成通路相关基因	第76-80页
小结	第80-81页
第四章总结	第81-83页
参考文献	第83-87页
文献综述	第87-102页
综述参考文献	第96-102页
致谢	第102-103页
攻读学位期间发表的学术论文目录	第103-104页
个人简介	第104-105页
开题、中期及学位论文答辩委员组成	第105页

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