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基于恒温核酸扩增的沙门氏菌检测方法的研究

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基于恒温核酸扩增的沙门氏菌检测方法的研究
论文目录
 
摘要第1-5页
abstract第5-10页
第一章 文献综述第10-32页
  1.1 沙门氏菌简介第10页
  1.2 沙门氏菌检测方法第10-29页
    1.2.1 培养法第11-12页
    1.2.2 免疫学法第12-13页
    1.2.3 核酸杂交法第13-14页
    1.2.4 变温核酸扩增方法第14-16页
    1.2.5 等温核酸扩增方法第16-27页
      1.2.5.1 环介导等温扩增第16-18页
      1.2.5.2 依赖于解旋酶的等温核酸扩增第18-19页
      1.2.5.3 交叉引物等温扩增技术第19-20页
      1.2.5.4 重组酶聚合扩增第20-21页
      1.2.5.5 滚环扩增第21-22页
      1.2.5.6 指数等温扩增第22-24页
      1.2.5.7 单引物引发的核酸扩增第24-25页
      1.2.5.8 基于变性泡介导的链交换扩增第25-27页
    1.2.6 传统沙门氏菌RNA检测方法第27-29页
      1.2.6.1 反转录聚合酶链式扩增第27-28页
      1.2.6.2 依赖核酸序列的扩增第28-29页
      1.2.6.3 反转录环介导等温核酸扩增第29页
  1.3 不同表征方法在沙门氏菌核酸检测中的应用第29-30页
  1.4 本论文的研究意义与主要内容第30-32页
第二章 等温核酸扩增反应对沙门氏菌检测的研究第32-54页
  2.1 引言第32-34页
  2.2 实验部分第34-41页
    2.2.1 仪器与试剂第34-35页
    2.2.2 沙门氏菌培养基的配制及增菌培养第35页
    2.2.3 沙门氏菌基因组DNA的提取第35-36页
    2.2.4 琼脂糖凝胶电泳第36-37页
      2.2.4.1 琼脂糖凝胶电泳的原理第36-37页
      2.2.4.2 琼脂糖凝胶电泳的制备第37页
    2.2.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳第37-39页
      2.2.5.1 聚丙烯酰胺凝胶电泳的原理第37-38页
      2.2.5.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳的制备第38-39页
      2.2.5.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测产物第39页
    2.2.6 实时荧光检测体系第39-41页
      2.2.6.1 环介导等温扩增反应体系第39-40页
      2.2.6.2 基于变性泡介导的链交换扩增反应体系第40-41页
  2.3 结果讨论第41-52页
    2.3.1 沙门氏菌基因组DNA电泳表征第41-43页
    2.3.2 环介导等温核酸扩增反应对沙门氏菌检测的研究第43-48页
      2.3.2.1 环介导等温核酸扩增反应实验原理第43页
      2.3.2.2 LAMP反应扩增温度的研究第43-44页
      2.3.2.3 LAMP反应体系的优化第44-46页
      2.3.2.4 灵敏度的检测第46-47页
      2.3.2.5 对提高LAMP反应速率的探究第47-48页
    2.3.3 变性泡介导的链交换扩增对沙门氏菌检测的研究第48-52页
      2.3.3.1 实验机理验证第49页
      2.3.3.2 SEA方法对沙门氏菌的特异性检测第49-50页
      2.3.3.3 SEA方法对沙门氏菌的灵敏度检测第50-51页
      2.3.3.4 抗干扰检测第51-52页
  2.4 小结第52-54页
第三章 基于内切酶和聚合酶联用的链交换扩增核酸检测方法的建立第54-78页
  3.1 引言第54-56页
  3.2 实验部分第56-60页
    3.2.1 仪器与试剂第56-58页
    3.2.2 RNA的提取与浓度估计第58-59页
    3.2.3 模拟样本的处理第59页
    3.2.4 高等链交换扩增(ASEA)反应体系第59-60页
      3.2.4.1 实时荧光检测体系第59页
      3.2.4.2 肉眼可视化比色检测体系第59-60页
  3.3 实验方案设计第60-63页
    3.3.1 实验原理第60-62页
    3.3.2 核酸链的设计第62-63页
  3.4 结果与讨论第63-76页
    3.4.1 实验机理验证第63-64页
    3.4.2 SEA-EXPAR扩增方法的构建第64-65页
    3.4.3 ASEA与SEA-EXPAR方法的比较第65-66页
    3.4.4 不同浓度寨卡病毒RNA的检测第66-67页
    3.4.5 DNA聚合酶的浓度优化第67-68页
    3.4.6 限制性核酸内切酶的浓度优化第68-69页
    3.4.7 ASEA方法灵敏度验证第69-71页
    3.4.8 ASEA方法特异性检测第71-73页
    3.4.9 ASEA方法抗干扰能力检测第73-74页
    3.4.10 沙门氏菌RNA灵敏度验证第74-75页
    3.4.11 沙门氏菌模拟实际样本的检测第75-76页
  3.5 本章小结第76-78页
第四章 展望第78-81页
结论第81-83页
参考文献第83-90页
附录:论文中使用的缩略词第90-91页
致谢第91-92页
攻读硕士学位期间发表的论文目录第92-93页

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