论文目录 | |
摘要 | 第1-6页 |
Summary | 第6-9页 |
1 前言 | 第9-25页 |
· 烟碱是烟叶生产的主要目的物 | 第9-15页 |
· 烟碱的性质及用途 | 第9-10页 |
· 烟碱的合成 | 第10-11页 |
· 调控烟碱合成的方法和技术 | 第11-15页 |
· 遗传调控 | 第11-13页 |
· 环境影响 | 第13页 |
· 栽培技术 | 第13-14页 |
· 生理活性物质 | 第14-15页 |
· 植物基因表达与杂种优势的形成 | 第15-18页 |
· 植物基因表达调控概述 | 第15-16页 |
· 杂种优势形成的机理 | 第16-17页 |
· 基因表达调控与杂种优势关系 | 第17-18页 |
· 基因差异表达的研究方法和技术 | 第18-21页 |
· 实时荧光定量PCR技术 | 第19页 |
· 抑制性消减杂交法(SSH) | 第19-20页 |
· 转录组测序技术 | 第20-21页 |
· 生物信息学分析方法和技术 | 第21-24页 |
· cDNA文库构建 | 第22页 |
· 表达序列标签(EST) | 第22-23页 |
· 生物分子数据库 | 第23-24页 |
· 研究目的和意义 | 第24-25页 |
2 材料和方法 | 第25-36页 |
· 材料来源 | 第25-26页 |
· 技术路线 | 第26-28页 |
· 试验方法与技术 | 第28-36页 |
· 不同优势杂交组合筛选 | 第28-29页 |
· 田间试验方法 | 第28页 |
· 样品制备 | 第28页 |
· 烟叶烟碱含量的测定 | 第28-29页 |
· 总RNA提取 | 第29-31页 |
· 总RNA提取前准备 | 第29页 |
· 总RNA提取方法 | 第29-30页 |
· 总RNA的纯度和完整性检测 | 第30-31页 |
· 文库构建及测序 | 第31页 |
· cDNA文库构建 | 第31页 |
· EST序列生物信息学分析 | 第31-36页 |
· 原始数据过滤 | 第32页 |
· 参考序列比对分析 | 第32-33页 |
· 基因表达水平分析 | 第33-34页 |
· 差异表达分析 | 第34页 |
· 差异基因GO功能分类 | 第34-35页 |
· 差异基因KEGG分析 | 第35-36页 |
3 结果与分析 | 第36-56页 |
· 不同优势杂交组合的筛选 | 第36-39页 |
· 2014年各杂交组合烟碱含量杂种优势表现分析 | 第36-38页 |
· 2015年各杂交组合杂种优势表现 | 第38-39页 |
· RNA提取 | 第39-40页 |
· EST序列生物信息学分析 | 第40-56页 |
· 测序产量统计 | 第40-41页 |
· 参考序列比对结果 | 第41-45页 |
· 干净序列与参考基因组比对情况统计 | 第41-43页 |
· 序列在参考基因组不同区域的分布情况 | 第43-45页 |
· 基因表达水平分析 | 第45页 |
· 差异表达基因分析 | 第45-47页 |
· 差异基因GO富集分类 | 第47-51页 |
· 差异基因KEGG分析 | 第51-56页 |
4 小结与讨论 | 第56-65页 |
· 不同优势材料的筛选 | 第57-58页 |
· cDNA文库的质量控制 | 第58-59页 |
· 测序数据处理与质量控制 | 第59-60页 |
· 基因表达计算结果分析 | 第60页 |
· 差异表达基因的筛选 | 第60-61页 |
· 与烟碱合成相关的差异表达基因分析 | 第61-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-78页 |
附录 | 第78-79页 |
附件一 Va116×巴斯玛VS Va116吡啶生物碱合成代谢途径的通路图 | 第79-80页 |
附件二 Va116×巴斯玛VS Va116烟酸和烟酰胺代谢通路 | 第80-81页 |
附件三 Va116×巴斯玛VS巴斯玛吡啶生物碱合成代谢途径的通路图 | 第81-82页 |
附件四 Va116×巴斯玛VS巴斯玛烟酸和烟酰胺代谢通路 | 第82-83页 |
附件五 Va116×巴斯玛VS Va116×GDH88吡啶生物碱合成 | 第83-84页 |
附件六 Va116×巴斯玛VS Va116×GDH88烟酸和烟酰胺代谢 | 第84-85页 |