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基于字符间隔距离的生物序列模型及其应用
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基于字符间隔距离的生物序列模型及其应用
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
第1章 绪论第10-18页
　　1.1 课题背景及研究的目的和意义第10-12页
　　　　1.1.1 基于生物大数据的数学建模方法第10-11页
　　　　1.1.2 生物数学模型的重要应用第11-12页
　　1.2 物种的系统发育分析第12-13页
　　　　1.2.1 物种的系统发育分析目的及意义第12页
　　　　1.2.2 物种的系统发育分析方法第12-13页
　　1.3 非编码RNA预测第13-14页
　　　　1.3.1 非编码RNA的相关概念第13页
　　　　1.3.2 非编码RNA的预测方法第13-14页
　　1.4 论文的主要研究内容第14-18页
　　　　1.4.1 预备知识第14-16页
　　　　1.4.2 论文的主要研究内容第16-18页
第2章 基于字符间隔距离的生物序列模型第18-25页
　　2.1 基于碱基间隔距离的DNA序列模型第18-23页
　　　　2.1.1 碱基间隔距离序列第19-20页
　　　　2.1.2 碱基间隔距离序列重构DNA序列第20-21页
　　　　2.1.3 基于碱基间隔距离序列的20维特征向量第21-23页
　　2.2 基于氨基酸间隔距离的蛋白质序列模型第23-24页
　　　　2.2.1 氨基酸间隔距离序列第23页
　　　　2.2.2 氨基酸间隔距离序列重构蛋白质序列第23-24页
　　　　2.2.3 基于氨基酸间隔距离序列的100维特征向量第24页
　　2.3 本章小结第24-25页
第3章 基于字符间隔距离的生物序列相似性分析第25-51页
　　3.1 DNA序列的相似性分析第26-36页
　　　　3.1.1 真哺乳亚纲动物的相似性分析第26-31页
　　　　3.1.2 线粒体RNA数据集相似性分析第31-36页
　　　　3.1.3 经典的11物种相似性分析第36页
　　3.2 非编码RNA序列相似性分析第36-41页
　　3.3 蛋白质序列相似性分析第41-50页
　　　　3.3.1 ND5数据集相似性分析第41-43页
　　　　3.3.2 FG数据集相似性分析第43-47页
　　　　3.3.3 转铁蛋白相似性分析第47-50页
　　3.4 本章小结第50-51页
第4章 基于碱基间隔距离的必需基因识别第51-56页
　　4.1 支持向量机和AUC面积第51-52页
　　4.2 机器学习中的评价指标第52-53页
　　4.3 五类细菌的必需基因识别第53-55页
　　4.4 本章小结第55-56页
结论第56-58页
参考文献第58-63页
攻读硕士学位期间承担的科研任务与主要成果第63-64页
致谢第64页

本篇论文共64页，点击这进入下载页面。
 
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