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石河子地区设施樱桃病毒病害调查及病原病毒种类鉴定与检测

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石河子地区设施樱桃病毒病害调查及病原病毒种类鉴定与检测
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
中英符号缩略表第10-11页
引言第11-12页
第一章 文献综述第12-20页
  1.1 樱桃病毒病发生概况第12-13页
    1.1.1 地理分布第12页
    1.1.2 樱桃病毒病研究现状及分析第12-13页
  1.2 樱桃主要病毒、危害及特性第13-15页
    1.2.1 李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ring spot virus, PNRSV)第13页
    1.2.2 李矮缩病毒(Prunus dwarf virus, PDV)第13页
    1.2.3 樱桃病毒A(Cherry virus A, CVA)第13-14页
    1.2.4 樱桃绿环斑驳病毒(Cherry green ring mottlevirus, CGRMV)第14-15页
    1.2.5 苹果褪绿叶斑病毒(Apple chlorotic leafspot virus, ACLSV)第15页
    1.2.6 樱桃锉叶病毒(Cherry rasp leaf virus, CRLV)及樱桃小果病毒(Little cherry virus, LChV)第15页
  1.3 樱桃病毒检测方法研究第15-18页
    1.3.1 樱桃病毒病症状诊断法第16页
    1.3.2 电子显微镜检测第16页
    1.3.3 分子生物学检测第16-18页
  1.4 本研究的目的及意义第18-20页
第二章 新疆石河子地区设施樱桃病毒病害调查及病原病毒的鉴定第20-40页
  2.1 实验材料第20-21页
    2.1.1 样品采集及调查地点第20-21页
    2.1.2 主要试剂第21页
    2.1.3 主要仪器第21页
  2.2 实验方法第21-26页
    2.2.1 樱桃病毒病症状类型及发病情况的调查第21页
    2.2.2 数据处理第21页
    2.2.3 病毒形态电镜观察第21页
    2.2.4 病毒基因克隆第21-26页
    2.2.5 序列测定及分析第26页
  2.3 结果与分析第26-39页
    2.3.1 石河子地区设施樱桃田间发病症状第26-27页
    2.3.2 樱桃病原病毒电镜观察及分析第27-28页
    2.3.3 设施樱桃病毒分子鉴定第28-29页
    2.3.4 石河子地区樱桃病毒分离物与其他分离物同源性及进化关系分析第29-37页
    2.3.5 石河子地区设施樱桃樱桃病毒检出率第37-39页
  2.4 结论与讨论第39-40页
第三章 樱桃病毒PNRSV、CGRMV、PDV多重RT-PCR检测方法的建立与应用第40-48页
  3.1 实验材料第40-41页
  3.2 实验方法第41页
    3.2.1 植物组织总RNA的提取第41页
    3.2.2 引物设计第41页
    3.2.3 多重RT-PCR检测第41页
    3.2.4 PCR产物的克隆及测序第41页
    3.2.5 多重RT- PCR主要影响因素的优化第41页
    3.2.6 多重RT-PCR检测方法的实际应用第41页
  3.3 结果与分析第41-46页
    3.3.1 单重RT-PCR扩增结果第41-42页
    3.3.2 多重RT-PCR体系建立第42-43页
    3.3.3 多重RT- PCR检测体系优化第43-45页
    3.3.4 多重RT-PCR的灵敏度分析第45-46页
    3.3.5 PCR扩增产物序列分析第46页
    3.3.6 应用多重RT-PCR技术检测新疆石河子地区樱桃带毒情况第46页
  3.4 结论与讨论第46-48页
第四章 新疆石河子地区樱桃病毒分离物CVA-SHZ基因组全序列分析第48-58页
  4.1 材料与方法第48-50页
    4.1.1 实验材料第48页
    4.1.2 主要试剂第48页
    4.1.3 引物合成第48-49页
    4.1.4 植物组织总RNA的提取第49页
    4.1.5 RT-PCR反应第49页
    4.1.6 PCR产物的回收与克隆第49页
    4.1.7 序列测定及分析第49-50页
  4.2 结果与分析第50-56页
    4.2.1 RT-PCR扩增结果第50页
    4.2.2 CVA-SHZ全基因组序列扩增第50-51页
    4.2.3 CVA-SHZ基因组结构分析第51-52页
    4.2.4 CVA-SHZ全基因及基因组结构与Capillovirus属病毒其它CVA分离物的同源性比较第52-54页
    4.2.5 樱桃病毒CVA-SHZ分离物的系统进化关系分析第54-56页
  4.3 结论与讨论第56-58页
第五章 全文小结第58-59页
参考文献第59-65页
附录A 常用化学试剂、分子生物学试剂及仪器第65-66页
附录B 常用培养基及缓冲液配方第66-67页
致谢第67-68页
作者简介第68-69页
石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表第69页

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