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重测序策略挖掘多浪羊多胎基因及候选基因与产羔数的分析

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重测序策略挖掘多浪羊多胎基因及候选基因与产羔数的分析
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-7页
缩略表(Abbreviations)第7-11页
引言第11-12页
第一章 文献综述第12-28页
1、全基因组重测序第12-16页
  1.1 全基因组重测序概念第12页
  1.2 高通量测序技术第12-16页
  1.3 全基因重测序的应用第16页
2、全基因组选择信号检测法第16-19页
  2.1 选择信号基本概念第16-17页
  2.2 选择信号检测方法第17-18页
  2.3 选择信号检测研究进展第18-19页
3、全基因组关联分析第19-22页
  3.1 GWAS概述第19-20页
  3.2 GWAS试验设计第20-21页
  3.3 GWAS在动物研究中的应用第21-22页
4、核受体辅激活蛋白1基因(Nuclear receptor co-activatorl gene,NCOA1)第22-26页
  4.1 核受体辅激活蛋白 1(NCOA1)基因概况第22页
  4.2 核受体结构功能第22-23页
  4.3 核受体辅调节因子第23页
  4.4 核受体辅激活蛋白作用机制及生物学特性第23-26页
  4.5 NCOA1基因研究进展第26页
5、抑制素 βA基因(βA-inhibin,INHBA)第26-27页
  5.1 抑制素基因概述第26页
  5.2 抑制素基因的分子结构第26-27页
  5.3 抑制素作用机制第27页
  5.4 抑制素基因与绵羊产羔数的关系第27页
6、研究目的及意义第27-28页
第二章 试验部分第28-59页
试验一 重测序挖掘多浪羊多胎候选基因第28-42页
1、试验材料第28-29页
  1.1 试验材料采集第28页
  1.2 主要试剂、溶液及配制第28-29页
  1.3 试验仪器第29页
2、试验方法第29-31页
  2.1 技术路线第29-30页
  2.2 样本DNA提取方法第30-31页
  2.3 测序及数据质控第31页
3、数据分析第31-33页
  3.1 选择信号检测第31-32页
  3.2 计算杂合度第32-33页
  3.3 全基因组关联分析(pool-GWAS)第33页
  3.4 基因注释与富集分析第33页
4、试验结果第33-39页
  4.1 DNA提取结果第33页
  4.1 测序数据质量情况第33-35页
  4.2 基于Fst检验数据分析第35-37页
  4.3 基于杂合度的数据分析第37-38页
  4.4 基于pool-GWAS的数据分析第38-39页
5、讨论第39-42页
  5.1 Fst检验讨论第39-40页
  5.2 杂合度讨论第40页
  5.3 全基因组关联分析讨论第40页
  5.4 候选基因的讨论第40-42页
试验二 NCOA1基因与多浪羊产羔数关联分析第42-53页
1、试验材料第42-43页
  1.1 试验材料采集第42页
  1.2 主要试剂、溶液及配制第42页
  1.3 试验设备第42-43页
2、试验方法第43-45页
  2.1 样品DNA提取第43页
  2.2 引物设计第43页
  2.3 PCR扩增及反应条件第43-44页
  2.4 数据分析方法第44页
  2.5 群体遗传学分析第44-45页
3、试验结果第45-51页
  3.1 多浪羊DNA提取结果第45-46页
  3.2 NCOA1基因不同引物PCR结果第46-48页
  3.3 NCOA1不同PCR产物测序结果第48-50页
  3.4 NCOA1基因遗传学分析第50-51页
4、讨论第51-53页
试验三 INHBA基因与多浪羊产羔数相关性分析第53-59页
1、试验材料第53页
  1.1 试验材料采集第53页
  1.2 主要试剂、溶液及配制第53页
  1.3 试验设备第53页
2、试验方法第53-54页
  2.1 样品DNA提取第53页
  2.2 引物设计第53页
  2.3 PCR扩增及反应条件第53-54页
  2.4 数据分析方法第54页
  2.5 群体遗传学研究方法第54页
3、试验结果第54-57页
  3.1 多浪羊DNA提取结果第54页
  3.2 INHBA基因不同引物PCR结果第54-55页
  3.3 INHBA不同PCR产物测序结果第55-56页
  3.4 INHBA基因遗传学分析第56-57页
4、小结与讨论第57-59页
结语第59-60页
创新点第60页
存在问题第60-61页
参考文献第61-67页
致谢第67-68页
作者简历第68-69页
石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表第69页

本篇论文共69页,点击这进入下载页面
 
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