猪生物发酵床垫料中细菌群落结构动态变化研究

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猪生物发酵床垫料中细菌群落结构动态变化研究

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猪生物发酵床垫料中细菌群落结构动态变化研究

论文目录
摘要	第1-10页
ABSTRACT	第10-12页
论文使用的符号和縮写词	第12-13页
第一章文献综述	第13-25页
1 引言	第13-16页
· 我国畜禽养殖业污染的现状	第13-15页
· 水源污染	第13页
· 土壤污染	第13-14页
· 大气污染	第14页
· 兽药残留污染	第14页
· 疾病传播	第14-15页
· 畜禽污染的处理技术	第15-16页
· 粪便综合利用	第15页
· 环保饲料技术	第15-16页
· 畜禽业防臭剂开发	第16页
2 生物发酵床养猪技术	第16-20页
· 生物发酵床养猪技术的概念	第16页
· 生物发酵床养猪技术的原理	第16-17页
· 生物发酵床技术的研究进展	第17-18页
· 生物发酵床养猪技术的缺点	第18-20页
· 垫料来源困难,圈舍建造成本高	第19页
· 实施严格的消毒防疫程序比较困难	第19页
· 疾病控制比较困难	第19-20页
· 菌种效率低且供应困难	第20页
· 夏天温度过高	第20页
3 微生物多样性的研究方法	第20-24页
· 传统培养法	第20-21页
· 分子杂交技术	第21页
· 磷脂脂肪酸分析(PLFA)	第21页
· 基于16SrRNA基因微生物多样性研究技术	第21-24页
· PCR-DGGE在微生物学研究中的应用	第22页
· 限制性片段长度多态性分析(RFLP)	第22-24页
4 研究的目的与意义	第24-25页
第二章材料和方法	第25-37页
1 材料	第25-30页
· 试验材料	第25页
· 培养基	第25-26页
· 常规试剂药品及试剂盒	第26-27页
· 常用的试剂药品	第26页
· 酶及试剂盒	第26-27页
· 常用缓冲液及试剂的配制	第27-29页
· 主要的试验仪器	第29-30页
2 试验方法	第30-37页
· 采样	第30页
· 微生物的分离、纯化及保存	第30-31页
· 分离菌株的有机物筛选	第31页
· 筛选菌株的生理生化鉴定	第31-32页
· 筛选细菌16SrRNA分子生物学鉴定	第32-34页
· 细菌基因组DNA的提取	第32页
· 细菌16SrRNA片段的扩增	第32页
· PCR产物的纯化	第32页
· PCR产物的连接与转化	第32-33页
· 阳性克隆子的筛选	第33-34页
· PCR-RFLP法分析猪生物发酵床细菌多样性	第34-37页
· 猪生物发酵床细菌总基因组DNA的提取	第34页
· 细菌V5-V9区16SrRNA基因PCR扩增	第34页
· PCR产物纯化	第34-35页
· 猪生物发酵床16SrRNA基因文库的构建	第35页
· 阳性克隆子的筛选	第35页
· 猪生物发酵床细菌RFLP酶切分型分析	第35-36页
· 系统发育树分析	第36-37页
第三章结果与分析	第37-58页
1 微生物的分离结果	第37页
2 分离菌株的有机物筛选	第37-40页
· 淀粉水解试验	第37-38页
· 明胶液化试验	第38页
· 油脂水解试验	第38页
· 纤维素降解试验	第38-40页
3 筛选菌株的生理生化鉴定	第40-41页
4 细菌基因组总DNA的提取	第41页
5 细菌的16SrDNA的扩增	第41-42页
· 细菌近全长16SrDNA的扩增	第41-42页
· 细菌总基因组V5-V9区16SrDAN的扩增	第42页
7 RFLP分析	第42-44页
8 序列和系统进化分析	第44-58页
· 保育期不同年限样品16SrDNA序列和系统进化分析	第44-51页
· 保育期不同年限样品的16SrDNA序列比对结果	第44-47页
· 保育期不同年限样品的系统发育分析	第47-51页
· 育成期不同年限样品16SrDNA序列和系统进化分析	第51-58页
· 育成期不同年限样品16SrDNA序列序列分析	第51-54页
· 育成期不同年限样品系统发育分析	第54-58页
第四章讨论	第58-63页
1 微生物的鉴定方法	第58页
2 生物发酵床样品基因组总DNA的提取	第58-59页
3 生物发酵床样品高质量基因文库的构建	第59页
4 RFLP分析	第59-61页
· 保育期样品16SrDNA的RFLP分析	第60-61页
· 育成期样品16SrDNA的RFLP分析	第61页
5 分子发育分析	第61-63页
第五章小结	第63-65页
参考文献	第65-71页
附录(获得的菌株16SrDNA基因序列)	第71-75页
致谢	第75 页

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