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基于胡萝卜软腐欧文氏菌基因组信息的农用杀菌活性化合物的筛选

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基于胡萝卜软腐欧文氏菌基因组信息的农用杀菌活性化合物的筛选
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-8页
1 文献综述第8-12页
  · 细菌性软腐病菌及其它植物致病菌基因组研究现状第8-9页
  · 通过代谢网络重构来寻找和验证药物作用靶标的研究现状第9-10页
  · 国内外农药研发的现状、研究趋势及存在问题第10-11页
  · 本课题的研究意义第11-12页
2 胡萝卜软腐欧文氏菌代谢网络的重构第12-18页
  · 引言第12-14页
  · 材料与方法第14-16页
    · 基于全基因组尺度的代谢网络重构过程第14页
    · 代谢网络构建技术第14页
    · 代谢网络的初步构建第14-15页
    · 反应方向的修正第15页
    · 通用代谢物的剔除第15页
    · 网络的可视化第15-16页
  · 结果与分析第16-18页
    · 小世界效应第17-18页
    · 无标度网络第18页
3 胡萝卜软腐欧文氏菌靶标的筛选第18-21页
  · 引言第18-19页
  · 材料与方法第19-20页
    · 用Cytoscape筛选代谢网络中重要的节点第19-20页
    · 与TTD靶标数据库的同源比对第20页
    · 流平衡分析第20页
  · 结果与分析第20-21页
4 靶标Upps三维结构的同源模建第21-26页
  · 引言第21-22页
  · 材料与方法第22-23页
    · 同源模建的软件平台第22-23页
    · 靶标Upps三维结构的同源模建过程第23页
  · 结果与分析第23-26页
5 虚拟筛选第26-30页
  · 引言第26页
  · 材料与方法第26-30页
    · 虚拟筛选的硬件平台第27页
    · 虚拟筛选的软件平台和筛选流程第27-28页
    · 小分子数据库的准备第28页
    · 用DOCK进行初筛第28-29页
    · 用AutoDock进行精筛第29页
    · 目筛第29-30页
  · 虚拟筛选的结果第30页
6 全文总结第30-32页
参考文献第32-38页
附录第38-44页
致谢第44-45页
作者简介第45 页

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